Make Zstd support optional
This commit is contained in:
@ -1,5 +1,9 @@
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find_package(ZLIB REQUIRED)
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find_package(ZLIB REQUIRED)
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target_link_libraries(lammps PRIVATE ZLIB::ZLIB)
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target_link_libraries(lammps PRIVATE ZLIB::ZLIB)
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find_package(Zstd REQUIRED)
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find_package(Zstd)
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if(Zstd_FOUND)
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target_compile_definitions(lammps PRIVATE -DLAMMPS_ZSTD)
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target_link_libraries(lammps PRIVATE Zstd::Zstd)
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target_link_libraries(lammps PRIVATE Zstd::Zstd)
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endif()
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@ -10,5 +10,9 @@ alternative for compressed file I/O on systems where using a pipe can
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cause problems, e.g. when using RDMA communication with pinned memory
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cause problems, e.g. when using RDMA communication with pinned memory
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like clusters with Infiniband or Myrinet.
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like clusters with Infiniband or Myrinet.
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Update 08/2020: Added variants that use the Zstd compression library instead
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of zlib. To enable, set -DLAMMPS_ZSTD. These provide a wider range of
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compression levels. See http://facebook.github.io/zstd/ for more details.
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Currently a few selected dump styles are supported for writing via
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Currently a few selected dump styles are supported for writing via
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this packaging.
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this packaging.
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@ -15,6 +15,8 @@
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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------------------------------------------------------------------------- */
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------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#include "dump_atom_zstd.h"
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#include "dump_atom_zstd.h"
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#include "domain.h"
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#include "domain.h"
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#include "error.h"
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#include "error.h"
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@ -189,3 +191,5 @@ int DumpAtomZstd::modify_param(int narg, char **arg)
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}
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}
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return consumed;
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return consumed;
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}
|
}
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#endif
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@ -15,6 +15,8 @@
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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------------------------------------------------------------------------- */
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------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#ifdef DUMP_CLASS
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#ifdef DUMP_CLASS
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DumpStyle(atom/zstd,DumpAtomZstd)
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DumpStyle(atom/zstd,DumpAtomZstd)
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@ -47,6 +49,7 @@ class DumpAtomZstd : public DumpAtom {
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}
|
}
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#endif
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#endif
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#endif
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#endif
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#endif
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@ -15,6 +15,7 @@
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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------------------------------------------------------------------------- */
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------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#include "dump_cfg_zstd.h"
|
#include "dump_cfg_zstd.h"
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#include "atom.h"
|
#include "atom.h"
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||||||
#include "domain.h"
|
#include "domain.h"
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@ -192,3 +193,4 @@ int DumpCFGZstd::modify_param(int narg, char **arg)
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}
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}
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return consumed;
|
return consumed;
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}
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}
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#endif
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@ -15,6 +15,7 @@
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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------------------------------------------------------------------------- */
|
------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#ifdef DUMP_CLASS
|
#ifdef DUMP_CLASS
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DumpStyle(cfg/zstd,DumpCFGZstd)
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DumpStyle(cfg/zstd,DumpCFGZstd)
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@ -47,6 +48,7 @@ class DumpCFGZstd : public DumpCFG {
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|||||||
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}
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}
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#endif
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#endif
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#endif
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#endif
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#endif
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@ -15,6 +15,8 @@
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
|
Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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------------------------------------------------------------------------- */
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------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#include "dump_custom_zstd.h"
|
#include "dump_custom_zstd.h"
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#include "domain.h"
|
#include "domain.h"
|
||||||
#include "error.h"
|
#include "error.h"
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||||||
@ -189,3 +191,5 @@ int DumpCustomZstd::modify_param(int narg, char **arg)
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|||||||
}
|
}
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return consumed;
|
return consumed;
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
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||||||
|
#endif
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||||||
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|||||||
@ -15,6 +15,8 @@
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|||||||
Contributing author: Richard Berger (Temple U)
|
Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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||||||
------------------------------------------------------------------------- */
|
------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#ifdef DUMP_CLASS
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#ifdef DUMP_CLASS
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DumpStyle(custom/zstd,DumpCustomZstd)
|
DumpStyle(custom/zstd,DumpCustomZstd)
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@ -48,6 +50,7 @@ class DumpCustomZstd : public DumpCustom {
|
|||||||
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}
|
}
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#endif
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#endif
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#endif
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#endif
|
#endif
|
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@ -15,6 +15,8 @@
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
|
Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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------------------------------------------------------------------------- */
|
------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#include "dump_local_zstd.h"
|
#include "dump_local_zstd.h"
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||||||
#include "domain.h"
|
#include "domain.h"
|
||||||
#include "error.h"
|
#include "error.h"
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||||||
@ -189,3 +191,5 @@ int DumpLocalZstd::modify_param(int narg, char **arg)
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|||||||
}
|
}
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return consumed;
|
return consumed;
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||||||
}
|
}
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||||||
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||||||
|
#endif
|
||||||
|
|||||||
@ -15,6 +15,8 @@
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|||||||
Contributing author: Richard Berger (Temple U)
|
Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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||||||
------------------------------------------------------------------------- */
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------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#ifdef DUMP_CLASS
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#ifdef DUMP_CLASS
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DumpStyle(local/zstd,DumpLocalZstd)
|
DumpStyle(local/zstd,DumpLocalZstd)
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@ -47,6 +49,7 @@ class DumpLocalZstd : public DumpLocal {
|
|||||||
|
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}
|
}
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#endif
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#endif
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#endif
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#endif
|
#endif
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@ -15,6 +15,8 @@
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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------------------------------------------------------------------------- */
|
------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#include "dump_xyz_zstd.h"
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#include "dump_xyz_zstd.h"
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#include "error.h"
|
#include "error.h"
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#include "update.h"
|
#include "update.h"
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@ -164,3 +166,5 @@ int DumpXYZZstd::modify_param(int narg, char **arg)
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}
|
}
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return consumed;
|
return consumed;
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}
|
}
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#endif
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@ -15,6 +15,8 @@
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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Contributing author: Richard Berger (Temple U)
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------------------------------------------------------------------------- */
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------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef LAMMPS_ZSTD
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#ifdef DUMP_CLASS
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#ifdef DUMP_CLASS
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DumpStyle(xyz/zstd,DumpXYZZstd)
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DumpStyle(xyz/zstd,DumpXYZZstd)
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@ -47,6 +49,7 @@ class DumpXYZZstd : public DumpXYZ {
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}
|
}
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#endif
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#endif
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#endif
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#endif
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#endif
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