git-svn-id: svn://svn.icms.temple.edu/lammps-ro/trunk@4634 f3b2605a-c512-4ea7-a41b-209d697bcdaa
This commit is contained in:
@ -11,6 +11,7 @@ if (test $1 = 1) then
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cp pair_eam.cpp ..
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cp pair_eam.cpp ..
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cp pair_eam_alloy.cpp ..
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cp pair_eam_alloy.cpp ..
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cp pair_eam_fs.cpp ..
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cp pair_eam_fs.cpp ..
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cp pair_eim.cpp ..
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cp pair_sw.cpp ..
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cp pair_sw.cpp ..
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cp pair_tersoff.cpp ..
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cp pair_tersoff.cpp ..
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cp pair_tersoff_zbl.cpp ..
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cp pair_tersoff_zbl.cpp ..
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@ -21,6 +22,7 @@ if (test $1 = 1) then
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cp pair_eam.h ..
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cp pair_eam.h ..
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cp pair_eam_alloy.h ..
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cp pair_eam_alloy.h ..
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cp pair_eam_fs.h ..
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cp pair_eam_fs.h ..
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||||||
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cp pair_eim.h ..
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cp pair_sw.h ..
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cp pair_sw.h ..
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cp pair_tersoff.h ..
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cp pair_tersoff.h ..
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cp pair_tersoff_zbl.h ..
|
cp pair_tersoff_zbl.h ..
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@ -37,6 +39,7 @@ elif (test $1 = 0) then
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rm ../pair_eam.cpp
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rm ../pair_eam.cpp
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rm ../pair_eam_alloy.cpp
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rm ../pair_eam_alloy.cpp
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rm ../pair_eam_fs.cpp
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rm ../pair_eam_fs.cpp
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||||||
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rm ../pair_eim.cpp
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||||||
rm ../pair_sw.cpp
|
rm ../pair_sw.cpp
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||||||
rm ../pair_tersoff.cpp
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rm ../pair_tersoff.cpp
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rm ../pair_tersoff_zbl.cpp
|
rm ../pair_tersoff_zbl.cpp
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@ -47,6 +50,7 @@ elif (test $1 = 0) then
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rm ../pair_eam.h
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rm ../pair_eam.h
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rm ../pair_eam_alloy.h
|
rm ../pair_eam_alloy.h
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rm ../pair_eam_fs.h
|
rm ../pair_eam_fs.h
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||||||
|
rm ../pair_eim.h
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||||||
rm ../pair_sw.h
|
rm ../pair_sw.h
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||||||
rm ../pair_tersoff.h
|
rm ../pair_tersoff.h
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||||||
rm ../pair_tersoff_zbl.h
|
rm ../pair_tersoff_zbl.h
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1172
src/MANYBODY/pair_eim.cpp
Normal file
1172
src/MANYBODY/pair_eim.cpp
Normal file
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
101
src/MANYBODY/pair_eim.h
Normal file
101
src/MANYBODY/pair_eim.h
Normal file
@ -0,0 +1,101 @@
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/* ----------------------------------------------------------------------
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LAMMPS - Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator
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http://lammps.sandia.gov, Sandia National Laboratories
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Steve Plimpton, sjplimp@sandia.gov
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Copyright (2003) Sandia Corporation. Under the terms of Contract
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DE-AC04-94AL85000 with Sandia Corporation, the U.S. Government retains
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certain rights in this software. This software is distributed under
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the GNU General Public License.
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See the README file in the top-level LAMMPS directory.
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------------------------------------------------------------------------- */
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#ifdef PAIR_CLASS
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PairStyle(eim,PairEIM)
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#else
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#ifndef LMP_PAIR_EIM_H
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#define LMP_PAIR_EIM_H
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#include "stdio.h"
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#include "pair.h"
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namespace LAMMPS_NS {
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class PairEIM : public Pair {
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public:
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PairEIM(class LAMMPS *);
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~PairEIM();
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void compute(int, int);
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void settings(int, char **);
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void coeff(int, char **);
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void init_style();
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double init_one(int, int);
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int pack_comm(int, int *, double *, int, int *);
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void unpack_comm(int, int, double *);
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int pack_reverse_comm(int, int, double *);
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void unpack_reverse_comm(int, int *, double *);
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|
double memory_usage();
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private:
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double **cutforcesq,cutmax;
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int nmax;
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double *rho,*fp;
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int rhofp;
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int *map; // which element each atom type maps to
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int nelements; // # of elements to read from potential file
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char **elements; // element names
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struct Setfl {
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|
double division,rbig,rsmall;
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int nr;
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int *ielement,*tp;
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double *mass,*negativity,*ra,*ri,*Ec,*q0;
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|
double *rcutphiA,*rcutphiR,*Eb,*r0,*alpha,*beta,
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|
*rcutq,*Asigma,*rq,*rcutsigma,*Ac,*zeta,
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|
*rs;
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|
double dr,cut;
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|
double ***Fij,***Gij,***phiij;
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|
double **cuts;
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};
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Setfl *setfl;
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// potentials as array data
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int nr;
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|
int nFij,nGij,nphiij;
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|
double **Fij,**Gij,**phiij;
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||||||
|
int **type2Fij,**type2Gij,**type2phiij;
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||||||
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|
// potentials in spline form used for force computation
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|
double dr,rdr;
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double *negativity,*q0;
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double ***Fij_spline,***Gij_spline,***phiij_spline;
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|
void allocate();
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void array2spline();
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|
void interpolate(int, double, double *, double **, double);
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int grabglobal(FILE *);
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|
int grabsingle(FILE *, int);
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|
int grabpair(FILE *, int, int);
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|
double funccutoff(double, double, double);
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|
double funcphi(int, int, double);
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|
double funcsigma(int, int, double);
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|
double funccoul(int, int, double);
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||||||
|
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||||||
|
void read_file(char *);
|
||||||
|
void deallocate_setfl();
|
||||||
|
void file2array();
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||||||
|
};
|
||||||
|
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|
}
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#endif
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#endif
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