add nocoeff flag to all zero styles to allow them to ignore coefficients, so that data files with any force field data can be read
This commit is contained in:
@ -17,9 +17,11 @@
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#include <math.h>
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#include <stdlib.h>
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#include <string.h>
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#include "angle_zero.h"
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#include "atom.h"
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#include "force.h"
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#include "comm.h"
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#include "memory.h"
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#include "error.h"
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@ -27,7 +29,7 @@ using namespace LAMMPS_NS;
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/* ---------------------------------------------------------------------- */
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AngleZero::AngleZero(LAMMPS *lmp) : Angle(lmp) {}
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AngleZero::AngleZero(LAMMPS *lmp) : Angle(lmp), check_coeffs(1) {}
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/* ---------------------------------------------------------------------- */
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@ -35,6 +37,7 @@ AngleZero::~AngleZero()
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{
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if (allocated && !copymode) {
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memory->destroy(setflag);
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memory->destroy(theta0);
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}
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}
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@ -48,11 +51,25 @@ void AngleZero::compute(int eflag, int vflag)
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/* ---------------------------------------------------------------------- */
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void AngleZero::settings(int narg, char **arg)
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{
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if ((narg != 0) && (narg != 1))
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error->all(FLERR,"Illegal angle_style command");
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if (narg == 1) {
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if (strcmp("nocoeffs",arg[0]) == 0) check_coeffs=0;
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else error->all(FLERR,"Illegal angle_style command");
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}
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}
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/* ---------------------------------------------------------------------- */
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void AngleZero::allocate()
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{
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allocated = 1;
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int n = atom->nangletypes;
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memory->create(theta0,n+1,"angle:theta0");
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memory->create(setflag,n+1,"angle:setflag");
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for (int i = 1; i <= n; i++) setflag[i] = 0;
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}
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@ -63,15 +80,23 @@ void AngleZero::allocate()
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void AngleZero::coeff(int narg, char **arg)
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{
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if (narg != 1) error->all(FLERR,"Incorrect args for angle coefficients");
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if ((narg < 1) || (check_coeffs && narg > 2))
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error->all(FLERR,"Incorrect args for angle coefficients");
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if (!allocated) allocate();
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int ilo,ihi;
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force->bounds(arg[0],atom->nangletypes,ilo,ihi);
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double theta0_one = 0.0;
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if (check_coeffs && (narg == 2))
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theta0_one = force->numeric(FLERR,arg[1]);
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int count = 0;
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for (int i = ilo; i <= ihi; i++) {
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setflag[i] = 1;
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theta0[i] = theta0_one;
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count++;
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}
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@ -82,14 +107,16 @@ void AngleZero::coeff(int narg, char **arg)
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double AngleZero::equilibrium_angle(int i)
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{
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return 0.0;
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return theta0[i];
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}
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proc 0 writes out coeffs to restart file
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------------------------------------------------------------------------- */
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void AngleZero::write_restart(FILE *fp) {}
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void AngleZero::write_restart(FILE *fp) {
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fwrite(&theta0[1],sizeof(double),atom->nangletypes,fp);
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}
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/* ----------------------------------------------------------------------
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proc 0 reads coeffs from restart file, bcasts them
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@ -98,8 +125,23 @@ void AngleZero::write_restart(FILE *fp) {}
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void AngleZero::read_restart(FILE *fp)
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{
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allocate();
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if (comm->me == 0) {
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fread(&theta0[1],sizeof(double),atom->nangletypes,fp);
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}
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MPI_Bcast(&theta0[1],atom->nangletypes,MPI_DOUBLE,0,world);
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for (int i = 1; i <= atom->nangletypes; i++) setflag[i] = 1;
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}
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/* ----------------------------------------------------------------------
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proc 0 writes to data file
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------------------------------------------------------------------------- */
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void AngleZero::write_data(FILE *fp)
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{
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for (int i = 1; i <= atom->nangletypes; i++)
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fprintf(fp,"%d %g\n",i,theta0[i]);
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}
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/* ---------------------------------------------------------------------- */
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