fix documentation issues (spelling, references, non-ASCII chars)

doc/utils/sphinx-config/false_positives.txt

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 biomolecular
 biomolecule
 Biomolecules
+biomolecules
 Biophys
 Biosym
 biquadratic
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 bitmapped
 bitmask
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 bitrate
 bitrates
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 ChiralIDs
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 Cho
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 ChooseOffset
 chris
 Christoph
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 cstyle
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 Devemy
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 Papaconstantopoulos
 papayawhip
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 Paxton
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 peru
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 PowerShell
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 Pre
 prec
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 radialspin
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 utils
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 Xie