ICODE-ADC/lammps
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Renamed pair style, user package: nnp => hdnnp

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Andreas Singraber
2021-04-01 00:35:17 +02:00
parent 6dfd475175
commit 7b9dfb296d
28 changed files with 204 additions and 205 deletions
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examples/USER/nnp/data.H2O-360mol → examples/USER/hdnnp/data.H2O-360mol
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examples/USER/nnp/nnp-data/input.nn → examples/USER/hdnnp/hdnnp-data/input.nn
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examples/USER/nnp/nnp-data/scaling.data → examples/USER/hdnnp/hdnnp-data/scaling.data
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examples/USER/nnp/nnp-data/weights.001.data → examples/USER/hdnnp/hdnnp-data/weights.001.data
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examples/USER/nnp/nnp-data/weights.008.data → examples/USER/hdnnp/hdnnp-data/weights.008.data
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examples/USER/nnp/in.nnp → examples/USER/hdnnp/in.hdnnp
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@ -1,5 +1,5 @@
###############################################################################
# MD simulation for NN water
# MD simulation for HDNNP water
###############################################################################
###############################################################################
@ -11,9 +11,9 @@ variable cfgFile string "data.H2O-360mol"
# Timesteps
variable numSteps equal 10
variable dt equal 0.0005
# NN
variable nnpCutoff equal 6.36
variable nnpDir string "nnp-data"
# HDNNP
variable hdnnpCutoff equal 6.36
variable hdnnpDir string "hdnnp-data"
###############################################################################
# GENERAL SETUP
@ -26,10 +26,10 @@ timestep ${dt}
thermo 1
###############################################################################
# NN
# HDNNP
###############################################################################
pair_style nnp dir ${nnpDir} showew no showewsum 5 resetew no maxew 100 cflength 1.8897261328 cfenergy 0.0367493254 emap "1:H,2:O"
pair_coeff * * ${nnpCutoff}
pair_style hdnnp dir ${hdnnpDir} showew no showewsum 5 resetew no maxew 100 cflength 1.8897261328 cfenergy 0.0367493254 emap "1:H,2:O"
pair_coeff * * ${hdnnpCutoff}
###############################################################################
# INTEGRATOR
@ -39,7 +39,7 @@ fix INT all nve
###############################################################################
# OUTPUT
###############################################################################
dump 1 all atom 1 dump.nnp
dump 1 all atom 1 dump.hdnnp
###############################################################################
# SIMULATION