ICODE-ADC/lammps
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Oliver Henrich
2024-05-15 16:07:59 +01:00
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commit a7fe12cd7b
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16
examples/PACKAGES/cgdna/examples/test.sh
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@ -18,7 +18,7 @@ if [ $# -eq 1 ] && [ $1 = run ]; then
make -j8 mpi | tee -a $EXDIR/test.log
######################################################
echo '# Running oxDNA duplex1 test' | tee -a $EXDIR/test.log
printf '\n# Running oxDNA duplex1 test\n' | tee -a $EXDIR/test.log
cd $EXDIR/oxDNA/duplex1
mkdir test
cd test
@ -53,7 +53,7 @@ if [ $# -eq 1 ] && [ $1 = run ]; then
######################################################
######################################################
echo '# Running oxDNA duplex2 test' | tee -a $EXDIR/test.log
printf '\n# Running oxDNA duplex2 test\n' | tee -a $EXDIR/test.log
cd $EXDIR/oxDNA/duplex2
mkdir test
cd test
@ -88,7 +88,7 @@ if [ $# -eq 1 ] && [ $1 = run ]; then
######################################################
######################################################
echo '# Running oxDNA2 duplex1 test' | tee -a $EXDIR/test.log
printf '\n# Running oxDNA2 duplex1 test\n' | tee -a $EXDIR/test.log
cd $EXDIR/oxDNA2/duplex1
mkdir test
cd test
@ -123,7 +123,7 @@ if [ $# -eq 1 ] && [ $1 = run ]; then
######################################################
######################################################
echo '# Running oxDNA2 duplex2 test' | tee -a $EXDIR/test.log
printf '\n# Running oxDNA2 duplex2 test\n' | tee -a $EXDIR/test.log
cd $EXDIR/oxDNA2/duplex2
mkdir test
cd test
@ -158,7 +158,7 @@ if [ $# -eq 1 ] && [ $1 = run ]; then
######################################################
######################################################
echo '# Running oxDNA2 duplex3 test' | tee -a $EXDIR/test.log
printf '\n# Running oxDNA2 duplex3 test\n' | tee -a $EXDIR/test.log
cd $EXDIR/oxDNA2/duplex3
mkdir test
cd test
@ -193,7 +193,7 @@ if [ $# -eq 1 ] && [ $1 = run ]; then
######################################################
######################################################
echo '# Running oxDNA2 unique_bp test' | tee -a $EXDIR/test.log
printf '\n# Running oxDNA2 unique_bp test\n' | tee -a $EXDIR/test.log
cd $EXDIR/oxDNA2/unique_bp
mkdir test
cd test
@ -254,7 +254,7 @@ if [ $# -eq 1 ] && [ $1 = run ]; then
######################################################
######################################################
echo '# Running oxDNA2 dsring test' | tee -a $EXDIR/test.log
printf'\n# Running oxDNA2 dsring test\n' | tee -a $EXDIR/test.log
cd $EXDIR/oxDNA2/dsring
mkdir test
cd test
@ -289,7 +289,7 @@ if [ $# -eq 1 ] && [ $1 = run ]; then
######################################################
######################################################
echo '# Running oxRNA2 duplex2 test' | tee -a $EXDIR/test.log
printf '\n# Running oxRNA2 duplex2 test\n' | tee -a $EXDIR/test.log
cd $EXDIR/oxRNA2/duplex2
mkdir test
cd test