git-svn-id: svn://svn.icms.temple.edu/lammps-ro/trunk@10165 f3b2605a-c512-4ea7-a41b-209d697bcdaa
This commit is contained in:
sjplimp
@ -3,6 +3,7 @@
|
|||||||
|
|
||||||
// LAMMPS includes
|
// LAMMPS includes
|
||||||
#include "lammps.h"
|
#include "lammps.h"
|
||||||
|
#include "lmptype.h"
|
||||||
#include "atom.h" // x, v, f
|
#include "atom.h" // x, v, f
|
||||||
#include "domain.h" // for basing locations on regions
|
#include "domain.h" // for basing locations on regions
|
||||||
#include "region.h" // region bounding box and style
|
#include "region.h" // region bounding box and style
|
||||||
@ -609,7 +610,7 @@ void LammpsInterface::atomPE_init(void)
|
|||||||
}
|
}
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
void LammpsInterface::atomPE_addstep(int step)
|
void LammpsInterface::atomPE_addstep(LAMMPS_NS::bigint step)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
atomPE_->addstep(step);
|
atomPE_->addstep(step);
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|||||||
@ -131,4 +131,4 @@ DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
|||||||
# ------ CLEAN ------
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
clean:
|
clean:
|
||||||
rm *.o *.d *~ $(LIB)
|
-rm *.o *.d *~ $(LIB)
|
||||||
|
|||||||
5
lib/atc/Makefile.lammps
Normal file
5
lib/atc/Makefile.lammps
Normal file
@ -0,0 +1,5 @@
|
|||||||
|
# Settings that the LAMMPS build will import when this package library is used
|
||||||
|
|
||||||
|
user-atc_SYSINC =
|
||||||
|
user-atc_SYSLIB = -lblas -llapack
|
||||||
|
user-atc_SYSPATH =
|
||||||
@ -2,4 +2,5 @@
|
|||||||
|
|
||||||
user-atc_SYSINC =
|
user-atc_SYSINC =
|
||||||
user-atc_SYSLIB = -llinalg -lgfortran
|
user-atc_SYSLIB = -llinalg -lgfortran
|
||||||
user-atc_SYSPATH = -L../../lib/linalg
|
user-atc_SYSPATH = -L../../lib/linalg$(LIBOBJDIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
|||||||
149
lib/atc/Makefile.mingw32-cross
Normal file
149
lib/atc/Makefile.mingw32-cross
Normal file
@ -0,0 +1,149 @@
|
|||||||
|
# library build -*- makefile -*-
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = ATC_HardyKernel.cpp \
|
||||||
|
ATC_Transfer.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferHardy.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferThermal.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferUtility.cpp \
|
||||||
|
AtomicRegulator.cpp \
|
||||||
|
ElasticTimeIntegrator.cpp \
|
||||||
|
ElectronFlux.cpp \
|
||||||
|
ElectronHeatCapacity.cpp \
|
||||||
|
ElectronHeatFlux.cpp \
|
||||||
|
ElectronPhononExchange.cpp \
|
||||||
|
ExtrinsicModel.cpp \
|
||||||
|
ExtrinsicModelTwoTemperature.cpp \
|
||||||
|
FE_Element.cpp \
|
||||||
|
FE_Engine.cpp \
|
||||||
|
FE_Mesh.cpp \
|
||||||
|
FieldEulerIntegrator.cpp \
|
||||||
|
ImplicitSolveOperator.cpp \
|
||||||
|
Kinetostat.cpp \
|
||||||
|
LammpsInterface.cpp \
|
||||||
|
Material.cpp \
|
||||||
|
Matrix.cpp \
|
||||||
|
OutputManager.cpp \
|
||||||
|
PhysicsModelThermal.cpp \
|
||||||
|
PhysicsModelTwoTemperature.cpp \
|
||||||
|
PrescribedDataManager.cpp \
|
||||||
|
Solver.cpp \
|
||||||
|
Thermostat.cpp \
|
||||||
|
TimeFilter.cpp \
|
||||||
|
TimeIntegrator.cpp \
|
||||||
|
Vector.cpp \
|
||||||
|
XT_Function.cpp
|
||||||
|
|
||||||
|
INC = Array2D.h \
|
||||||
|
Array.h \
|
||||||
|
ATC_Error.h \
|
||||||
|
ATC_HardyKernel.h \
|
||||||
|
ATC_Transfer.h \
|
||||||
|
ATC_TransferHardy.h \
|
||||||
|
ATC_TransferThermal.h \
|
||||||
|
ATC_TypeDefs.h \ \
|
||||||
|
AtomicRegulator.h \
|
||||||
|
CG.h \
|
||||||
|
CloneVector.h \
|
||||||
|
DenseMatrix.h \
|
||||||
|
DenseVector.h \
|
||||||
|
DiagonalMatrix.h \
|
||||||
|
ElasticTimeIntegrator.h \
|
||||||
|
ElectronFlux.h \
|
||||||
|
ElectronHeatCapacity.h \
|
||||||
|
ElectronHeatFlux.h \
|
||||||
|
ElectronPhononExchange.h \
|
||||||
|
ExtrinsicModel.h \
|
||||||
|
ExtrinsicModelTwoTemperature.h \
|
||||||
|
FE_Element.h \
|
||||||
|
FE_Engine.h \
|
||||||
|
FE_Mesh.h \
|
||||||
|
FieldEulerIntegrator.h \
|
||||||
|
GMRES.h \
|
||||||
|
ImplicitSolveOperator.h \
|
||||||
|
Kinetostat.h \
|
||||||
|
LammpsInterface.h \
|
||||||
|
Material.h \
|
||||||
|
MatrixDef.h \
|
||||||
|
Matrix.h \
|
||||||
|
MatrixLibrary.h \
|
||||||
|
OutputManager.h \
|
||||||
|
PhysicsModel.h \
|
||||||
|
PhysicsModelThermal.h \
|
||||||
|
PhysicsModelTwoTemperature.h \
|
||||||
|
PrescribedDataManager.h \
|
||||||
|
Quadrature.h \
|
||||||
|
Solver.h \
|
||||||
|
SparseMatrix.h \
|
||||||
|
SparseMatrix-inl.h \
|
||||||
|
SparseVector.h \
|
||||||
|
SparseVector-inl.h \
|
||||||
|
StringManip.h \
|
||||||
|
Thermostat.h \
|
||||||
|
TimeFilter.h \
|
||||||
|
TimeIntegrator.h \
|
||||||
|
Utility.h \
|
||||||
|
Vector.h \
|
||||||
|
XT_Function.h
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.linalg
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw32/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libatc.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.cpp=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
# include any MPI settings needed for the ATC library to build with
|
||||||
|
# the same MPI library that LAMMPS is built with
|
||||||
|
|
||||||
|
CC = i686-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
CCFLAGS = -I../../src -I../../src/STUBS -DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK \
|
||||||
|
-O3 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 -mpc64 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing \
|
||||||
|
-DLAMMPS_SMALLSMALL -Wno-uninitialized
|
||||||
|
ARCHIVE = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
DEPFLAGS = -M
|
||||||
|
LINK = i686-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
LINKFLAGS = -O
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
Makefile.lammps:
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
$(DIR)%.d:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEPENDENCIES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
rm $(DIR)*.o $(DIR)*.d *~ $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DEPENDS) : $(DIR)
|
||||||
|
sinclude $(DEPENDS)
|
||||||
150
lib/atc/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
150
lib/atc/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,150 @@
|
|||||||
|
# library build -*- makefile -*-
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = ATC_HardyKernel.cpp \
|
||||||
|
ATC_Transfer.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferHardy.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferThermal.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferUtility.cpp \
|
||||||
|
AtomicRegulator.cpp \
|
||||||
|
ElasticTimeIntegrator.cpp \
|
||||||
|
ElectronFlux.cpp \
|
||||||
|
ElectronHeatCapacity.cpp \
|
||||||
|
ElectronHeatFlux.cpp \
|
||||||
|
ElectronPhononExchange.cpp \
|
||||||
|
ExtrinsicModel.cpp \
|
||||||
|
ExtrinsicModelTwoTemperature.cpp \
|
||||||
|
FE_Element.cpp \
|
||||||
|
FE_Engine.cpp \
|
||||||
|
FE_Mesh.cpp \
|
||||||
|
FieldEulerIntegrator.cpp \
|
||||||
|
ImplicitSolveOperator.cpp \
|
||||||
|
Kinetostat.cpp \
|
||||||
|
LammpsInterface.cpp \
|
||||||
|
Material.cpp \
|
||||||
|
Matrix.cpp \
|
||||||
|
OutputManager.cpp \
|
||||||
|
PhysicsModelThermal.cpp \
|
||||||
|
PhysicsModelTwoTemperature.cpp \
|
||||||
|
PrescribedDataManager.cpp \
|
||||||
|
Solver.cpp \
|
||||||
|
Thermostat.cpp \
|
||||||
|
TimeFilter.cpp \
|
||||||
|
TimeIntegrator.cpp \
|
||||||
|
Vector.cpp \
|
||||||
|
XT_Function.cpp
|
||||||
|
|
||||||
|
INC = Array2D.h \
|
||||||
|
Array.h \
|
||||||
|
ATC_Error.h \
|
||||||
|
ATC_HardyKernel.h \
|
||||||
|
ATC_Transfer.h \
|
||||||
|
ATC_TransferHardy.h \
|
||||||
|
ATC_TransferThermal.h \
|
||||||
|
ATC_TypeDefs.h \ \
|
||||||
|
AtomicRegulator.h \
|
||||||
|
CG.h \
|
||||||
|
CloneVector.h \
|
||||||
|
DenseMatrix.h \
|
||||||
|
DenseVector.h \
|
||||||
|
DiagonalMatrix.h \
|
||||||
|
ElasticTimeIntegrator.h \
|
||||||
|
ElectronFlux.h \
|
||||||
|
ElectronHeatCapacity.h \
|
||||||
|
ElectronHeatFlux.h \
|
||||||
|
ElectronPhononExchange.h \
|
||||||
|
ExtrinsicModel.h \
|
||||||
|
ExtrinsicModelTwoTemperature.h \
|
||||||
|
FE_Element.h \
|
||||||
|
FE_Engine.h \
|
||||||
|
FE_Mesh.h \
|
||||||
|
FieldEulerIntegrator.h \
|
||||||
|
GMRES.h \
|
||||||
|
ImplicitSolveOperator.h \
|
||||||
|
Kinetostat.h \
|
||||||
|
LammpsInterface.h \
|
||||||
|
Material.h \
|
||||||
|
MatrixDef.h \
|
||||||
|
Matrix.h \
|
||||||
|
MatrixLibrary.h \
|
||||||
|
OutputManager.h \
|
||||||
|
PhysicsModel.h \
|
||||||
|
PhysicsModelThermal.h \
|
||||||
|
PhysicsModelTwoTemperature.h \
|
||||||
|
PrescribedDataManager.h \
|
||||||
|
Quadrature.h \
|
||||||
|
Solver.h \
|
||||||
|
SparseMatrix.h \
|
||||||
|
SparseMatrix-inl.h \
|
||||||
|
SparseVector.h \
|
||||||
|
SparseVector-inl.h \
|
||||||
|
StringManip.h \
|
||||||
|
Thermostat.h \
|
||||||
|
TimeFilter.h \
|
||||||
|
TimeIntegrator.h \
|
||||||
|
Utility.h \
|
||||||
|
Vector.h \
|
||||||
|
XT_Function.h
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.linalg
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw32-mpi/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libatc.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.cpp=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
# include any MPI settings needed for the ATC library to build with
|
||||||
|
# the same MPI library that LAMMPS is built with
|
||||||
|
|
||||||
|
CC = i686-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
CCFLAGS = -I../../tools/mingw-cross/mpich2-win32/include/ \
|
||||||
|
-I../../src -I../../src/STUBS -DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK \
|
||||||
|
-O3 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 -mpc64 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing \
|
||||||
|
-DLAMMPS_SMALLSMALL -Wno-uninitialized
|
||||||
|
ARCHIVE = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
DEPFLAGS = -M
|
||||||
|
LINK = i686-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
LINKFLAGS = -O
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
Makefile.lammps:
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
$(DIR)%.d:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEPENDENCIES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
rm $(DIR)*.o $(DIR)*.d *~ $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DEPENDS) : $(DIR)
|
||||||
|
sinclude $(DEPENDS)
|
||||||
149
lib/atc/Makefile.mingw64-cross
Normal file
149
lib/atc/Makefile.mingw64-cross
Normal file
@ -0,0 +1,149 @@
|
|||||||
|
# library build -*- makefile -*-
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = ATC_HardyKernel.cpp \
|
||||||
|
ATC_Transfer.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferHardy.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferThermal.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferUtility.cpp \
|
||||||
|
AtomicRegulator.cpp \
|
||||||
|
ElasticTimeIntegrator.cpp \
|
||||||
|
ElectronFlux.cpp \
|
||||||
|
ElectronHeatCapacity.cpp \
|
||||||
|
ElectronHeatFlux.cpp \
|
||||||
|
ElectronPhononExchange.cpp \
|
||||||
|
ExtrinsicModel.cpp \
|
||||||
|
ExtrinsicModelTwoTemperature.cpp \
|
||||||
|
FE_Element.cpp \
|
||||||
|
FE_Engine.cpp \
|
||||||
|
FE_Mesh.cpp \
|
||||||
|
FieldEulerIntegrator.cpp \
|
||||||
|
ImplicitSolveOperator.cpp \
|
||||||
|
Kinetostat.cpp \
|
||||||
|
LammpsInterface.cpp \
|
||||||
|
Material.cpp \
|
||||||
|
Matrix.cpp \
|
||||||
|
OutputManager.cpp \
|
||||||
|
PhysicsModelThermal.cpp \
|
||||||
|
PhysicsModelTwoTemperature.cpp \
|
||||||
|
PrescribedDataManager.cpp \
|
||||||
|
Solver.cpp \
|
||||||
|
Thermostat.cpp \
|
||||||
|
TimeFilter.cpp \
|
||||||
|
TimeIntegrator.cpp \
|
||||||
|
Vector.cpp \
|
||||||
|
XT_Function.cpp
|
||||||
|
|
||||||
|
INC = Array2D.h \
|
||||||
|
Array.h \
|
||||||
|
ATC_Error.h \
|
||||||
|
ATC_HardyKernel.h \
|
||||||
|
ATC_Transfer.h \
|
||||||
|
ATC_TransferHardy.h \
|
||||||
|
ATC_TransferThermal.h \
|
||||||
|
ATC_TypeDefs.h \ \
|
||||||
|
AtomicRegulator.h \
|
||||||
|
CG.h \
|
||||||
|
CloneVector.h \
|
||||||
|
DenseMatrix.h \
|
||||||
|
DenseVector.h \
|
||||||
|
DiagonalMatrix.h \
|
||||||
|
ElasticTimeIntegrator.h \
|
||||||
|
ElectronFlux.h \
|
||||||
|
ElectronHeatCapacity.h \
|
||||||
|
ElectronHeatFlux.h \
|
||||||
|
ElectronPhononExchange.h \
|
||||||
|
ExtrinsicModel.h \
|
||||||
|
ExtrinsicModelTwoTemperature.h \
|
||||||
|
FE_Element.h \
|
||||||
|
FE_Engine.h \
|
||||||
|
FE_Mesh.h \
|
||||||
|
FieldEulerIntegrator.h \
|
||||||
|
GMRES.h \
|
||||||
|
ImplicitSolveOperator.h \
|
||||||
|
Kinetostat.h \
|
||||||
|
LammpsInterface.h \
|
||||||
|
Material.h \
|
||||||
|
MatrixDef.h \
|
||||||
|
Matrix.h \
|
||||||
|
MatrixLibrary.h \
|
||||||
|
OutputManager.h \
|
||||||
|
PhysicsModel.h \
|
||||||
|
PhysicsModelThermal.h \
|
||||||
|
PhysicsModelTwoTemperature.h \
|
||||||
|
PrescribedDataManager.h \
|
||||||
|
Quadrature.h \
|
||||||
|
Solver.h \
|
||||||
|
SparseMatrix.h \
|
||||||
|
SparseMatrix-inl.h \
|
||||||
|
SparseVector.h \
|
||||||
|
SparseVector-inl.h \
|
||||||
|
StringManip.h \
|
||||||
|
Thermostat.h \
|
||||||
|
TimeFilter.h \
|
||||||
|
TimeIntegrator.h \
|
||||||
|
Utility.h \
|
||||||
|
Vector.h \
|
||||||
|
XT_Function.h
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.linalg
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw64/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libatc.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.cpp=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
# include any MPI settings needed for the ATC library to build with
|
||||||
|
# the same MPI library that LAMMPS is built with
|
||||||
|
|
||||||
|
CC = x86_64-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
CCFLAGS = -I../../src -I../../src/STUBS -DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK \
|
||||||
|
-O3 -march=core2 -mtune=core2 -mpc64 -msse2 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing \
|
||||||
|
-DLAMMPS_SMALLBIG -Wno-uninitialized
|
||||||
|
ARCHIVE = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
DEPFLAGS = -M
|
||||||
|
LINK = x86_64-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
LINKFLAGS = -O
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
Makefile.lammps:
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
$(DIR)%.d:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEPENDENCIES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
rm $(DIR)*.o $(DIR)*.d *~ $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DEPENDS) : $(DIR)
|
||||||
|
sinclude $(DEPENDS)
|
||||||
150
lib/atc/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
150
lib/atc/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,150 @@
|
|||||||
|
# library build -*- makefile -*-
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = ATC_HardyKernel.cpp \
|
||||||
|
ATC_Transfer.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferHardy.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferThermal.cpp \
|
||||||
|
ATC_TransferUtility.cpp \
|
||||||
|
AtomicRegulator.cpp \
|
||||||
|
ElasticTimeIntegrator.cpp \
|
||||||
|
ElectronFlux.cpp \
|
||||||
|
ElectronHeatCapacity.cpp \
|
||||||
|
ElectronHeatFlux.cpp \
|
||||||
|
ElectronPhononExchange.cpp \
|
||||||
|
ExtrinsicModel.cpp \
|
||||||
|
ExtrinsicModelTwoTemperature.cpp \
|
||||||
|
FE_Element.cpp \
|
||||||
|
FE_Engine.cpp \
|
||||||
|
FE_Mesh.cpp \
|
||||||
|
FieldEulerIntegrator.cpp \
|
||||||
|
ImplicitSolveOperator.cpp \
|
||||||
|
Kinetostat.cpp \
|
||||||
|
LammpsInterface.cpp \
|
||||||
|
Material.cpp \
|
||||||
|
Matrix.cpp \
|
||||||
|
OutputManager.cpp \
|
||||||
|
PhysicsModelThermal.cpp \
|
||||||
|
PhysicsModelTwoTemperature.cpp \
|
||||||
|
PrescribedDataManager.cpp \
|
||||||
|
Solver.cpp \
|
||||||
|
Thermostat.cpp \
|
||||||
|
TimeFilter.cpp \
|
||||||
|
TimeIntegrator.cpp \
|
||||||
|
Vector.cpp \
|
||||||
|
XT_Function.cpp
|
||||||
|
|
||||||
|
INC = Array2D.h \
|
||||||
|
Array.h \
|
||||||
|
ATC_Error.h \
|
||||||
|
ATC_HardyKernel.h \
|
||||||
|
ATC_Transfer.h \
|
||||||
|
ATC_TransferHardy.h \
|
||||||
|
ATC_TransferThermal.h \
|
||||||
|
ATC_TypeDefs.h \ \
|
||||||
|
AtomicRegulator.h \
|
||||||
|
CG.h \
|
||||||
|
CloneVector.h \
|
||||||
|
DenseMatrix.h \
|
||||||
|
DenseVector.h \
|
||||||
|
DiagonalMatrix.h \
|
||||||
|
ElasticTimeIntegrator.h \
|
||||||
|
ElectronFlux.h \
|
||||||
|
ElectronHeatCapacity.h \
|
||||||
|
ElectronHeatFlux.h \
|
||||||
|
ElectronPhononExchange.h \
|
||||||
|
ExtrinsicModel.h \
|
||||||
|
ExtrinsicModelTwoTemperature.h \
|
||||||
|
FE_Element.h \
|
||||||
|
FE_Engine.h \
|
||||||
|
FE_Mesh.h \
|
||||||
|
FieldEulerIntegrator.h \
|
||||||
|
GMRES.h \
|
||||||
|
ImplicitSolveOperator.h \
|
||||||
|
Kinetostat.h \
|
||||||
|
LammpsInterface.h \
|
||||||
|
Material.h \
|
||||||
|
MatrixDef.h \
|
||||||
|
Matrix.h \
|
||||||
|
MatrixLibrary.h \
|
||||||
|
OutputManager.h \
|
||||||
|
PhysicsModel.h \
|
||||||
|
PhysicsModelThermal.h \
|
||||||
|
PhysicsModelTwoTemperature.h \
|
||||||
|
PrescribedDataManager.h \
|
||||||
|
Quadrature.h \
|
||||||
|
Solver.h \
|
||||||
|
SparseMatrix.h \
|
||||||
|
SparseMatrix-inl.h \
|
||||||
|
SparseVector.h \
|
||||||
|
SparseVector-inl.h \
|
||||||
|
StringManip.h \
|
||||||
|
Thermostat.h \
|
||||||
|
TimeFilter.h \
|
||||||
|
TimeIntegrator.h \
|
||||||
|
Utility.h \
|
||||||
|
Vector.h \
|
||||||
|
XT_Function.h
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.linalg
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw64-mpi/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libatc.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.cpp=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
# include any MPI settings needed for the ATC library to build with
|
||||||
|
# the same MPI library that LAMMPS is built with
|
||||||
|
|
||||||
|
CC = x86_64-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
CCFLAGS = -I../../tools/mingw-cross/mpich2-win64/include/ \
|
||||||
|
-I../../src -I../../src/STUBS -DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK \
|
||||||
|
-O3 -march=core2 -mtune=core2 -mpc64 -msse2 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing \
|
||||||
|
-DLAMMPS_SMALLBIG -Wno-uninitialized
|
||||||
|
ARCHIVE = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
DEPFLAGS = -M
|
||||||
|
LINK = x86_64-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
LINKFLAGS = -O
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
Makefile.lammps:
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
$(DIR)%.d:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEPENDENCIES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
rm $(DIR)*.o $(DIR)*.d *~ $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DEPENDS) : $(DIR)
|
||||||
|
sinclude $(DEPENDS)
|
||||||
@ -2,4 +2,4 @@
|
|||||||
|
|
||||||
user-awpmd_SYSINC =
|
user-awpmd_SYSINC =
|
||||||
user-awpmd_SYSLIB = -llinalg -lgfortran
|
user-awpmd_SYSLIB = -llinalg -lgfortran
|
||||||
user-awpmd_SYSPATH = -L../../lib/linalg
|
user-awpmd_SYSPATH = -L../../lib/linalg$(LIBOBJDIR)
|
||||||
|
|||||||
80
lib/awpmd/Makefile.mingw32-cross
Normal file
80
lib/awpmd/Makefile.mingw32-cross
Normal file
@ -0,0 +1,80 @@
|
|||||||
|
# library build -*- makefile -*-
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.linalg
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = logexc.cpp wpmd.cpp wpmd_split.cpp
|
||||||
|
vpath %.cpp ivutils/src
|
||||||
|
vpath %.cpp systems/interact/TCP
|
||||||
|
|
||||||
|
INC = \
|
||||||
|
cerf.h \
|
||||||
|
cerf2.h \
|
||||||
|
cerf_octave.h \
|
||||||
|
cvector_3.h \
|
||||||
|
lapack_inter.h \
|
||||||
|
logexc.h \
|
||||||
|
pairhash.h \
|
||||||
|
refobj.h \
|
||||||
|
tcpdefs.h \
|
||||||
|
vector_3.h \
|
||||||
|
wavepacket.h \
|
||||||
|
wpmd.h \
|
||||||
|
wpmd_split.h
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw32/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libawpmd.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.cpp=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
# include any MPI settings needed for the ATC library to build with
|
||||||
|
# the same MPI library that LAMMPS is built with
|
||||||
|
|
||||||
|
CC = i686-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
CCFLAGS = -O2 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 -mpc64 \
|
||||||
|
-finline-functions \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing \
|
||||||
|
-Wall -W -Wno-uninitialized -Isystems/interact/TCP/ -Isystems/interact -Iivutils/include
|
||||||
|
ARCHIVE = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rscv
|
||||||
|
DEPFLAGS = -M
|
||||||
|
#LINK =
|
||||||
|
#LINKFLAGS =
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
Makefile.lammps:
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
$(DIR)%.d:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEPENDENCIES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
rm *.d *~ $(OBJ) $(LIB)
|
||||||
13
lib/awpmd/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
13
lib/awpmd/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
# -*- makefile -*- wrapper for non-MPI libraries
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL=/bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) mingw32-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
ln -s Obj_mingw32 Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) clean-mingw32-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
|
||||||
79
lib/awpmd/Makefile.mingw64-cross
Normal file
79
lib/awpmd/Makefile.mingw64-cross
Normal file
@ -0,0 +1,79 @@
|
|||||||
|
# library build -*- makefile -*-
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.linalg
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = logexc.cpp wpmd.cpp wpmd_split.cpp
|
||||||
|
vpath %.cpp ivutils/src
|
||||||
|
vpath %.cpp systems/interact/TCP
|
||||||
|
|
||||||
|
INC = \
|
||||||
|
cerf.h \
|
||||||
|
cerf2.h \
|
||||||
|
cerf_octave.h \
|
||||||
|
cvector_3.h \
|
||||||
|
lapack_inter.h \
|
||||||
|
logexc.h \
|
||||||
|
pairhash.h \
|
||||||
|
refobj.h \
|
||||||
|
tcpdefs.h \
|
||||||
|
vector_3.h \
|
||||||
|
wavepacket.h \
|
||||||
|
wpmd.h \
|
||||||
|
wpmd_split.h
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw64/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libawpmd.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.cpp=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
# include any MPI settings needed for the ATC library to build with
|
||||||
|
# the same MPI library that LAMMPS is built with
|
||||||
|
|
||||||
|
CC = x86_64-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
CCFLAGS = -O3 -march=core2 -mtune=core2 -mpc64 -msse2 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing \
|
||||||
|
-Wall -W -Wno-uninitialized -Isystems/interact/TCP/ -Isystems/interact -Iivutils/include
|
||||||
|
ARCHIVE = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rscv
|
||||||
|
DEPFLAGS = -M
|
||||||
|
#LINK =
|
||||||
|
#LINKFLAGS =
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
Makefile.lammps:
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
$(DIR)%.d:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEPENDENCIES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
rm *.d *~ $(OBJ) $(LIB)
|
||||||
13
lib/awpmd/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
13
lib/awpmd/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
# -*- makefile -*- wrapper for non-MPI libraries
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL=/bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) mingw64-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
ln -s Obj_mingw64 Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) clean-mingw64-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
|
||||||
@ -8,7 +8,7 @@ typedef int lapack_int;
|
|||||||
typedef complex<float> lapack_complex_float;
|
typedef complex<float> lapack_complex_float;
|
||||||
typedef complex<double> lapack_complex_double;
|
typedef complex<double> lapack_complex_double;
|
||||||
|
|
||||||
#ifdef _WIN32
|
#if defined(_WIN32) && !defined(__MINGW32__)
|
||||||
|
|
||||||
//#define MKL_Complex8 lapack_complex_float
|
//#define MKL_Complex8 lapack_complex_float
|
||||||
//#define MKL_Complex16 lapack_complex_double
|
//#define MKL_Complex16 lapack_complex_double
|
||||||
|
|||||||
@ -7,9 +7,9 @@
|
|||||||
#include <stdexcept>
|
#include <stdexcept>
|
||||||
#include <string>
|
#include <string>
|
||||||
|
|
||||||
# ifndef _WIN32
|
#if !defined(_WIN32) || defined(__MINGW32__)
|
||||||
# include <typeinfo>
|
# include <typeinfo>
|
||||||
# endif
|
#endif
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
/// this specifies whether to put file/line info in error messages
|
/// this specifies whether to put file/line info in error messages
|
||||||
|
|||||||
@ -220,7 +220,8 @@ public:
|
|||||||
|
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
/*double w=wk.get_width();
|
#if 0
|
||||||
|
double w=wk.get_width();
|
||||||
Vector_3 r=wk.get_r();
|
Vector_3 r=wk.get_r();
|
||||||
double t=3/(2*w*w*w);
|
double t=3/(2*w*w*w);
|
||||||
fe_w[ic1+k1]+= t*E_der[s1][indw1+8*k1]+imag(wk.a)*E_der[s1][indw1+8*k1+1]/w;
|
fe_w[ic1+k1]+= t*E_der[s1][indw1+8*k1]+imag(wk.a)*E_der[s1][indw1+8*k1+1]/w;
|
||||||
@ -230,7 +231,8 @@ public:
|
|||||||
fe_p[ic1+k1][i]+= (-E_der[s1][indw1+8*k1+2+2*i+1])*(m_electron/h_plank); //*(h_plank/m_electron);
|
fe_p[ic1+k1][i]+= (-E_der[s1][indw1+8*k1+2+2*i+1])*(m_electron/h_plank); //*(h_plank/m_electron);
|
||||||
fe_pw[ic1+k1]+=(r[i]*E_der[s1][indw1+8*k1+2+2*i+1]/w)/h_plank;
|
fe_pw[ic1+k1]+=(r[i]*E_der[s1][indw1+8*k1+2+2*i+1]/w)/h_plank;
|
||||||
fe_w[ic1+k1]+=2*r[i]*(t*E_der[s1][indw1+8*k1+2+2*i]+imag(wk.a)*E_der[s1][indw1+8*k1+2+2*i+1]/w);
|
fe_w[ic1+k1]+=2*r[i]*(t*E_der[s1][indw1+8*k1+2+2*i]+imag(wk.a)*E_der[s1][indw1+8*k1+2+2*i+1]/w);
|
||||||
}*/
|
}
|
||||||
|
#endif
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
/// constructs a conjugate packet
|
/// constructs a conjugate packet
|
||||||
@ -239,4 +241,4 @@ inline WavePacket conj(const WavePacket &wp){
|
|||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
# endif // WAVEPACKET_H
|
# endif // WAVEPACKET_H
|
||||||
|
|||||||
5
lib/gpu/Makefile.lammps
Normal file
5
lib/gpu/Makefile.lammps
Normal file
@ -0,0 +1,5 @@
|
|||||||
|
# Settings that the LAMMPS build will import when this package library is used
|
||||||
|
|
||||||
|
gpu_SYSINC =
|
||||||
|
gpu_SYSLIB = -lcudart -lcuda
|
||||||
|
gpu_SYSPATH = -L/usr/local/cuda/lib64
|
||||||
6
lib/gpu/Makefile.lammps.mingw-cross
Normal file
6
lib/gpu/Makefile.lammps.mingw-cross
Normal file
@ -0,0 +1,6 @@
|
|||||||
|
# Settings that the LAMMPS build will import when this package library is used
|
||||||
|
# settings for OpenCL builds
|
||||||
|
gpu_SYSINC =
|
||||||
|
gpu_SYSLIB = -Wl,--enable-stdcall-fixup -L../../tools/mingw-cross$(LIBOBJDIR) -lOpenCL
|
||||||
|
gpu_SYSPATH =
|
||||||
|
|
||||||
17
lib/gpu/Makefile.mingw32-cross
Normal file
17
lib/gpu/Makefile.mingw32-cross
Normal file
@ -0,0 +1,17 @@
|
|||||||
|
CUDA_HOME = ../../tools/mingw-cross/OpenCL
|
||||||
|
|
||||||
|
OCL_CPP = i686-w64-mingw32-g++ -O2 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 \
|
||||||
|
-mpc64 -DMPI_GERYON -DUCL_NO_EXIT -I../../src/STUBS \
|
||||||
|
-I$(CUDA_HOME)/include
|
||||||
|
OCL_LINK = -Wl,--enable-stdcall-fixup -L$(CUDA_HOME)/../Obj_mingw32 -lOpenCL -L../../src/STUBS -lmpi_mingw32
|
||||||
|
OCL_PREC = -D_SINGLE_DOUBLE
|
||||||
|
OCL_TUNE = -DFERMI_OCL
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.mingw-cross
|
||||||
|
|
||||||
|
BIN_DIR = Obj_mingw32
|
||||||
|
OBJ_DIR = Obj_mingw32
|
||||||
|
LIB_DIR = Obj_mingw32
|
||||||
|
AR = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
BSH = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
include Opencl.makefile
|
||||||
19
lib/gpu/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
19
lib/gpu/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,19 @@
|
|||||||
|
CUDA_HOME = ../../tools/mingw-cross/OpenCL
|
||||||
|
|
||||||
|
OCL_CPP = i686-w64-mingw32-g++ -O2 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 \
|
||||||
|
-mpc64 -DMPI_GERYON -DUCL_NO_EXIT -I$(CUDA_HOME)/include \
|
||||||
|
-I../../tools/mingw-cross/mpich2-win32/include/ \
|
||||||
|
-DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK
|
||||||
|
OCL_LINK = -Wl,--enable-stdcall-fixup -L$(CUDA_HOME)/../Obj_mingw32 -lOpenCL \
|
||||||
|
-L../../tools/mingw-cross/mpich2-win32/lib -lmpi
|
||||||
|
OCL_PREC = -D_SINGLE_DOUBLE
|
||||||
|
OCL_TUNE = -DFERMI_OCL
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.mingw-cross
|
||||||
|
|
||||||
|
BIN_DIR = Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
OBJ_DIR = Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
LIB_DIR = Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
AR = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
BSH = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
include Opencl.makefile
|
||||||
18
lib/gpu/Makefile.mingw64-cross
Normal file
18
lib/gpu/Makefile.mingw64-cross
Normal file
@ -0,0 +1,18 @@
|
|||||||
|
CUDA_HOME = ../../tools/mingw-cross/OpenCL
|
||||||
|
|
||||||
|
OCL_CPP = x86_64-w64-mingw32-g++ -O3 -march=core2 -mtune=core2 -mpc64 \
|
||||||
|
-msse2 -DMPI_GERYON -DUCL_NO_EXIT -I../../src/STUBS \
|
||||||
|
-I$(CUDA_HOME)/include
|
||||||
|
OCL_LINK = -Wl,--enable-stdcall-fixup -L$(CUDA_HOME)/../Obj_mingw64 -lOpenCL \
|
||||||
|
-L../../src/STUBS -lmpi_mingw64
|
||||||
|
OCL_PREC = -D_SINGLE_DOUBLE
|
||||||
|
OCL_TUNE = -DFERMI_OCL
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.mingw-cross
|
||||||
|
|
||||||
|
BIN_DIR = Obj_mingw64
|
||||||
|
OBJ_DIR = Obj_mingw64
|
||||||
|
LIB_DIR = Obj_mingw64
|
||||||
|
AR = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
BSH = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
include Opencl.makefile
|
||||||
20
lib/gpu/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
20
lib/gpu/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,20 @@
|
|||||||
|
CUDA_HOME = ../../tools/mingw-cross/OpenCL
|
||||||
|
|
||||||
|
OCL_CPP = x86_64-w64-mingw32-g++ -O3 -march=core2 -mtune=core2 -mpc64 \
|
||||||
|
-msse2 -DMPI_GERYON -DUCL_NO_EXIT -I$(CUDA_HOME)/include \
|
||||||
|
-I../../tools/mingw-cross/mpich2-win64/include/ \
|
||||||
|
-DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK
|
||||||
|
|
||||||
|
OCL_LINK = -Wl,--enable-stdcall-fixup -L$(CUDA_HOME)/../Obj_mingw64 -lOpenCL \
|
||||||
|
-L../../tools/mingw-cross/mpich2-win64/lib -lmpi
|
||||||
|
OCL_PREC = -D_SINGLE_DOUBLE
|
||||||
|
OCL_TUNE = -DFERMI_OCL
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.mingw-cross
|
||||||
|
|
||||||
|
BIN_DIR = Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
OBJ_DIR = Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
LIB_DIR = Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
AR = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
BSH = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
include Opencl.makefile
|
||||||
@ -101,7 +101,10 @@ CBNS = $(OBJ_DIR)/device.cubin $(OBJ_DIR)/device_cubin.h \
|
|||||||
$(OBJ_DIR)/lj_coul_debye.cubin $(OBJ_DIR)/lj_coul_debye_cubin.h \
|
$(OBJ_DIR)/lj_coul_debye.cubin $(OBJ_DIR)/lj_coul_debye_cubin.h \
|
||||||
$(OBJ_DIR)/coul_dsf.cubin $(OBJ_DIR)/coul_dsf_cubin.h
|
$(OBJ_DIR)/coul_dsf.cubin $(OBJ_DIR)/coul_dsf_cubin.h
|
||||||
|
|
||||||
all: $(GPU_LIB) $(EXECS)
|
all: $(OBJ_DIR) $(GPU_LIB) $(EXECS)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(OBJ_DIR):
|
||||||
|
mkdir -p $@
|
||||||
|
|
||||||
$(OBJ_DIR)/cudpp.o: cudpp_mini/cudpp.cpp
|
$(OBJ_DIR)/cudpp.o: cudpp_mini/cudpp.cpp
|
||||||
$(CUDR) -o $@ -c cudpp_mini/cudpp.cpp -Icudpp_mini
|
$(CUDR) -o $@ -c cudpp_mini/cudpp.cpp -Icudpp_mini
|
||||||
|
|||||||
@ -73,7 +73,10 @@ KERS = $(OBJ_DIR)/device_cl.h $(OBJ_DIR)/atom_cl.h \
|
|||||||
|
|
||||||
OCL_EXECS = $(BIN_DIR)/ocl_get_devices
|
OCL_EXECS = $(BIN_DIR)/ocl_get_devices
|
||||||
|
|
||||||
all: $(OCL_LIB) $(EXECS)
|
all: $(OBJ_DIR) $(OCL_LIB) $(EXECS)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(OBJ_DIR):
|
||||||
|
mkdir -p $@
|
||||||
|
|
||||||
$(OBJ_DIR)/atom_cl.h: lal_atom.cu lal_preprocessor.h
|
$(OBJ_DIR)/atom_cl.h: lal_atom.cu lal_preprocessor.h
|
||||||
$(BSH) ./geryon/file_to_cstr.sh atom lal_preprocessor.h lal_atom.cu $(OBJ_DIR)/atom_cl.h
|
$(BSH) ./geryon/file_to_cstr.sh atom lal_preprocessor.h lal_atom.cu $(OBJ_DIR)/atom_cl.h
|
||||||
|
|||||||
85
lib/linalg/Makefile.mingw32-cross
Executable file
85
lib/linalg/Makefile.mingw32-cross
Executable file
@ -0,0 +1,85 @@
|
|||||||
|
# *
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*
|
||||||
|
# * Minimal BLAS/LAPACK Library for ATC and AWPMD
|
||||||
|
|
||||||
|
# To compile and link LAMMPS to the linalg library generated by this Makefile,
|
||||||
|
# adjust the corresponding definitions in the library's Makefile.lammps file.
|
||||||
|
#
|
||||||
|
# for lib/atc/Makefile.lammps use:
|
||||||
|
# user-atc_SYSINC =
|
||||||
|
# user-atc_SYSLIB = ../../lib/linalg/$(LIBOBJDIR)liblinalg.a -lgfortran
|
||||||
|
# user-atc_SYSPATH =
|
||||||
|
#
|
||||||
|
# for lib/awpmd/Makefile.lammps use:
|
||||||
|
# user-awpmd_SYSINC =
|
||||||
|
# user-awpmd_SYSLIB = ../../lib/linalg/$(LIBOBJDIR)liblinalg.a -lgfortran
|
||||||
|
# user-awpmd_SYSPATH =
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = dasum.f daxpy.f dcopy.f ddot.f dgecon.f dgemm.f dgemv.f dger.f \
|
||||||
|
dgetf2.f dgetrf.f dgetri.f disnan.f dlabad.f dlaisnan.f dlamch.f\
|
||||||
|
dlacn2.f dlange.f dlassq.f dlaswp.f dlatrs.f drscl.f dscal.f \
|
||||||
|
dswap.f dtrmm.f dtrmv.f dtrsm.f dtrsv.f dtrti2.f dtrtri.f \
|
||||||
|
idamax.f ieeeck.f ilaenv.f iparmq.f lsame.f xerbla.f zdotc.f \
|
||||||
|
zdscal.f zhpr.f zpptrf.f zpptri.f zscal.f ztpmv.f ztpsv.f ztptri.f
|
||||||
|
|
||||||
|
FILES = $(SRC) Makefile.* README
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw32/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)liblinalg.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.f=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
FC = i686-w64-mingw32-gfortran
|
||||||
|
FFLAGS = -O3 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 -mpc64 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing -Wall -W \
|
||||||
|
-Wno-uninitialized -fno-second-underscore
|
||||||
|
FFLAGS0 = -O0 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 -mpc64 \
|
||||||
|
-Wall -W -Wno-uninitialized -fno-second-underscore
|
||||||
|
ARCHIVE = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
AR = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
.PHONY: default clean tar
|
||||||
|
|
||||||
|
.SUFFIXES:
|
||||||
|
.SUFFIXES: .F .f .o
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.F
|
||||||
|
$(F90) $(F90FLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.f
|
||||||
|
$(FC) $(FFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)dlamch.o: dlamch.f
|
||||||
|
$(FC) $(FFLAGS0) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
-rm $(DIR)*.o $(DIR)*.mod *~ $(LIB)
|
||||||
|
-rmdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
tar:
|
||||||
|
-tar -czvf ../linalg.tar.gz $(FILES)
|
||||||
|
|
||||||
13
lib/linalg/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
13
lib/linalg/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
# -*- makefile -*- wrapper for non-MPI libraries
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL=/bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) mingw32-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
ln -s Obj_mingw32 Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) clean-mingw32-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
|
||||||
85
lib/linalg/Makefile.mingw64-cross
Executable file
85
lib/linalg/Makefile.mingw64-cross
Executable file
@ -0,0 +1,85 @@
|
|||||||
|
# *
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*
|
||||||
|
# * Minimal BLAS/LAPACK Library for ATC and AWPMD
|
||||||
|
|
||||||
|
# To compile and link LAMMPS to the linalg library generated by this Makefile,
|
||||||
|
# adjust the corresponding definitions in the library's Makefile.lammps file.
|
||||||
|
#
|
||||||
|
# for lib/atc/Makefile.lammps use:
|
||||||
|
# user-atc_SYSINC =
|
||||||
|
# user-atc_SYSLIB = ../../lib/linalg/$(LIBOBJDIR)liblinalg.a -lgfortran
|
||||||
|
# user-atc_SYSPATH =
|
||||||
|
#
|
||||||
|
# for lib/awpmd/Makefile.lammps use:
|
||||||
|
# user-awpmd_SYSINC =
|
||||||
|
# user-awpmd_SYSLIB = ../../lib/linalg/$(LIBOBJDIR)liblinalg.a -lgfortran
|
||||||
|
# user-awpmd_SYSPATH =
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = dasum.f daxpy.f dcopy.f ddot.f dgecon.f dgemm.f dgemv.f dger.f \
|
||||||
|
dgetf2.f dgetrf.f dgetri.f disnan.f dlabad.f dlaisnan.f dlamch.f\
|
||||||
|
dlacn2.f dlange.f dlassq.f dlaswp.f dlatrs.f drscl.f dscal.f \
|
||||||
|
dswap.f dtrmm.f dtrmv.f dtrsm.f dtrsv.f dtrti2.f dtrtri.f \
|
||||||
|
idamax.f ieeeck.f ilaenv.f iparmq.f lsame.f xerbla.f zdotc.f \
|
||||||
|
zdscal.f zhpr.f zpptrf.f zpptri.f zscal.f ztpmv.f ztpsv.f ztptri.f
|
||||||
|
|
||||||
|
FILES = $(SRC) Makefile.* README
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw64/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)liblinalg.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.f=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
FC = x86_64-w64-mingw32-gfortran
|
||||||
|
FFLAGS = -O3 -march=core2 -mtune=generic -msse2 -mpc64 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing -Wall -W \
|
||||||
|
-Wno-uninitialized -fno-second-underscore
|
||||||
|
FFLAGS0 = -O0 -march=core2 -mtune=generic -msse2 -mpc64 \
|
||||||
|
-Wall -W -Wno-uninitialized -fno-second-underscore
|
||||||
|
ARCHIVE = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
AR = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
.PHONY: default clean tar
|
||||||
|
|
||||||
|
.SUFFIXES:
|
||||||
|
.SUFFIXES: .F .f .o
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.F
|
||||||
|
$(F90) $(F90FLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.f
|
||||||
|
$(FC) $(FFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)dlamch.o: dlamch.f
|
||||||
|
$(FC) $(FFLAGS0) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
-rm $(DIR)*.o $(DOR)*.mod *~ $(LIB)
|
||||||
|
-rmdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
tar:
|
||||||
|
-tar -czvf ../linalg.tar.gz $(FILES)
|
||||||
|
|
||||||
13
lib/linalg/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
13
lib/linalg/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
# -*- makefile -*- wrapper for non-MPI libraries
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL=/bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) mingw64-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
ln -s Obj_mingw64 Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) clean-mingw64-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
|
||||||
65
lib/meam/Makefile.mingw32-cross
Normal file
65
lib/meam/Makefile.mingw32-cross
Normal file
@ -0,0 +1,65 @@
|
|||||||
|
# * -*- makefile -*-
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*
|
||||||
|
# * MEAM: MODEFIED EMBEDDED ATOM METHOD *
|
||||||
|
# * DESCRIPTION: SEE READ-ME *
|
||||||
|
# * FILE NAME: Makefile *
|
||||||
|
# * AUTHORS: Greg Wagner, Sandia National Laboratories *
|
||||||
|
# * CONTACT: gjwagne@sandia.gov *
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*/
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.gfortran
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = meam_data.F meam_setup_done.F meam_setup_global.F meam_setup_param.F meam_dens_init.F meam_dens_final.F meam_force.F meam_cleanup.F
|
||||||
|
|
||||||
|
FILES = $(SRC) Makefile
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw32/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libmeam.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.F=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
F90 = i686-w64-mingw32-gfortran
|
||||||
|
F90FLAGS = -O3 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 -mpc64 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing -J$(DIR) \
|
||||||
|
-Wall -W -Wno-uninitialized -fno-second-underscore
|
||||||
|
#F90FLAGS = -O
|
||||||
|
ARCHIVE = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
LINK = i686-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
LINKFLAGS = -O
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
-mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.F
|
||||||
|
$(F90) $(F90FLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
-rm $(DIR)*.o $(DIR)*.mod *~ $(LIB)
|
||||||
|
-rmdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
tar:
|
||||||
|
-tar -cvf ../MEAM.tar $(FILES)
|
||||||
13
lib/meam/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
13
lib/meam/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
# -*- makefile -*- wrapper for non-MPI libraries
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL=/bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) mingw32-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
ln -s Obj_mingw32 Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) clean-mingw32-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
|
||||||
65
lib/meam/Makefile.mingw64-cross
Normal file
65
lib/meam/Makefile.mingw64-cross
Normal file
@ -0,0 +1,65 @@
|
|||||||
|
# * -*- makefile -*-
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*
|
||||||
|
# * MEAM: MODEFIED EMBEDDED ATOM METHOD *
|
||||||
|
# * DESCRIPTION: SEE READ-ME *
|
||||||
|
# * FILE NAME: Makefile *
|
||||||
|
# * AUTHORS: Greg Wagner, Sandia National Laboratories *
|
||||||
|
# * CONTACT: gjwagne@sandia.gov *
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*/
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.gfortran
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = meam_data.F meam_setup_done.F meam_setup_global.F meam_setup_param.F meam_dens_init.F meam_dens_final.F meam_force.F meam_cleanup.F
|
||||||
|
|
||||||
|
FILES = $(SRC) Makefile
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw64/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libmeam.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.F=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
F90 = x86_64-w64-mingw32-gfortran
|
||||||
|
F90FLAGS = -O3 -march=core2 -mtune=core2 -msse2 -mpc64 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -fstrict-aliasing -J$(DIR) \
|
||||||
|
-Wall -W -Wno-uninitialized -fno-second-underscore
|
||||||
|
#F90FLAGS = -O
|
||||||
|
ARCHIVE = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
LINK = x86_64-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
LINKFLAGS = -O
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
-mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.F
|
||||||
|
$(F90) $(F90FLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
-rm $(DIR)*.o $(DIR)*.mod *~ $(LIB)
|
||||||
|
-rmdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
tar:
|
||||||
|
-tar -cvf ../MEAM.tar $(FILES)
|
||||||
13
lib/meam/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
13
lib/meam/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
# -*- makefile -*- wrapper for non-MPI libraries
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL=/bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) mingw64-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
ln -s Obj_mingw64 Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) clean-mingw64-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
|
||||||
113
lib/poems/Makefile.mingw32-cross
Normal file
113
lib/poems/Makefile.mingw32-cross
Normal file
@ -0,0 +1,113 @@
|
|||||||
|
# *
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*
|
||||||
|
# * POEMS: PARALLELIZABLE OPEN SOURCE EFFICIENT MULTIBODY SOFTWARE *
|
||||||
|
# * DESCRIPTION: SEE READ-ME *
|
||||||
|
# * FILE NAME: Makefile *
|
||||||
|
# * AUTHORS: See Author List *
|
||||||
|
# * GRANTS: See Grants List *
|
||||||
|
# * COPYRIGHT: (C) 2005 by Authors as listed in Author's List *
|
||||||
|
# * LICENSE: Please see License Agreement *
|
||||||
|
# * DOWNLOAD: Free at www.rpi.edu/~anderk5 *
|
||||||
|
# * ADMINISTRATOR: Prof. Kurt Anderson *
|
||||||
|
# * Computational Dynamics Lab *
|
||||||
|
# * Rensselaer Polytechnic Institute *
|
||||||
|
# * 110 8th St. Troy NY 12180 *
|
||||||
|
# * CONTACT: anderk5@rpi.edu *
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*/
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.empty
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_MAIN = workspace.cpp system.cpp poemsobject.cpp
|
||||||
|
INC_MAIN = workspace.h system.h poemsobject.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_BODY = body.cpp rigidbody.cpp particle.cpp inertialframe.cpp
|
||||||
|
INC_BODY = bodies.h body.h rigidbody.h particle.h inertialframe.h
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_JOINT = joint.cpp revolutejoint.cpp prismaticjoint.cpp sphericaljoint.cpp \
|
||||||
|
freebodyjoint.cpp body23joint.cpp mixedjoint.cpp
|
||||||
|
INC_JOINT = joints.h joint.h revolutejoint.h prismaticjoint.h sphericaljoint.h \
|
||||||
|
freebodyjoint.h body23joint.h mixedjoint.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_POINT = point.cpp fixedpoint.cpp
|
||||||
|
INC_POINT = points.h point.h fixedpoint.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_SOLVE = solver.cpp
|
||||||
|
INC_SOLVE = solver.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_ORDERN = onsolver.cpp onfunctions.cpp onbody.cpp
|
||||||
|
INC_ORDERN = onsolver.h onfunctions.h onbody.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_MAT = virtualmatrix.cpp matrix.cpp matrixfun.cpp mat3x3.cpp virtualcolmatrix.cpp \
|
||||||
|
colmatrix.cpp vect3.cpp virtualrowmatrix.cpp rowmatrix.cpp mat6x6.cpp vect6.cpp \
|
||||||
|
fastmatrixops.cpp colmatmap.cpp eulerparameters.cpp vect4.cpp norm.cpp mat4x4.cpp \
|
||||||
|
|
||||||
|
INC_MAT = matrices.h virtualmatrix.h matrix.h matrixfun.h mat3x3.h virtualcolmatrix.h \
|
||||||
|
colmatrix.h vect3.h virtualrowmatrix.h rowmatrix.h mat6x6.h vect6.h \
|
||||||
|
fastmatrixops.h colmatmap.h eulerparameters.h vect4.h norm.h mat4x4.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_MISC = poemstreenode.cpp
|
||||||
|
INC_MISC = poemslist.h poemstreenode.h poemstree.h poemsnodelib.h SystemProcessor.h defines.h POEMSChain.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = $(SRC_MAIN) $(SRC_BODY) $(SRC_JOINT) $(SRC_POINT) $(SRC_SOLVE) $(SRC_ORDERN) $(SRC_MAT) $(SRC_MISC)
|
||||||
|
INC = $(INC_MAIN) $(INC_BODY) $(INC_JOINT) $(INC_POINT) $(INC_SOLVE) $(INC_ORDERN) $(INC_MAT) $(INC_MISC)
|
||||||
|
|
||||||
|
FILES = $(SRC) $(INC) Makefile Authors_List.txt Grants_List.txt POEMS_License.txt README Copyright_Notice
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw32/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libpoems.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.cpp=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
CC = i686-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
CCFLAGS = -O2 -march=i686 -mtune=generic -mfpmath=387 -mpc64 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -finline-functions -fno-rtti \
|
||||||
|
-fno-exceptions -fstrict-aliasing \
|
||||||
|
-Wall -W -Wno-uninitialized
|
||||||
|
ARCHIVE = i686-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
DEPFLAGS = -M
|
||||||
|
LINK = i686-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
LINKFLAGS = -O
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
-mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.d:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEPENDENCIES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
-rm $(DIR)*.o $(DIR)*.d *~ $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
tar:
|
||||||
|
-tar -cvf ../POEMS.tar $(FILES)
|
||||||
13
lib/poems/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
13
lib/poems/Makefile.mingw32-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
# -*- makefile -*- wrapper for non-MPI libraries
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL=/bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) mingw32-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
ln -s Obj_mingw32 Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) clean-mingw32-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw32-mpi
|
||||||
|
|
||||||
113
lib/poems/Makefile.mingw64-cross
Normal file
113
lib/poems/Makefile.mingw64-cross
Normal file
@ -0,0 +1,113 @@
|
|||||||
|
# *
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*
|
||||||
|
# * POEMS: PARALLELIZABLE OPEN SOURCE EFFICIENT MULTIBODY SOFTWARE *
|
||||||
|
# * DESCRIPTION: SEE READ-ME *
|
||||||
|
# * FILE NAME: Makefile *
|
||||||
|
# * AUTHORS: See Author List *
|
||||||
|
# * GRANTS: See Grants List *
|
||||||
|
# * COPYRIGHT: (C) 2005 by Authors as listed in Author's List *
|
||||||
|
# * LICENSE: Please see License Agreement *
|
||||||
|
# * DOWNLOAD: Free at www.rpi.edu/~anderk5 *
|
||||||
|
# * ADMINISTRATOR: Prof. Kurt Anderson *
|
||||||
|
# * Computational Dynamics Lab *
|
||||||
|
# * Rensselaer Polytechnic Institute *
|
||||||
|
# * 110 8th St. Troy NY 12180 *
|
||||||
|
# * CONTACT: anderk5@rpi.edu *
|
||||||
|
# *_________________________________________________________________________*/
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL = /bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
# which file will be copied to Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
EXTRAMAKE = Makefile.lammps.empty
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ FILES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_MAIN = workspace.cpp system.cpp poemsobject.cpp
|
||||||
|
INC_MAIN = workspace.h system.h poemsobject.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_BODY = body.cpp rigidbody.cpp particle.cpp inertialframe.cpp
|
||||||
|
INC_BODY = bodies.h body.h rigidbody.h particle.h inertialframe.h
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_JOINT = joint.cpp revolutejoint.cpp prismaticjoint.cpp sphericaljoint.cpp \
|
||||||
|
freebodyjoint.cpp body23joint.cpp mixedjoint.cpp
|
||||||
|
INC_JOINT = joints.h joint.h revolutejoint.h prismaticjoint.h sphericaljoint.h \
|
||||||
|
freebodyjoint.h body23joint.h mixedjoint.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_POINT = point.cpp fixedpoint.cpp
|
||||||
|
INC_POINT = points.h point.h fixedpoint.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_SOLVE = solver.cpp
|
||||||
|
INC_SOLVE = solver.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_ORDERN = onsolver.cpp onfunctions.cpp onbody.cpp
|
||||||
|
INC_ORDERN = onsolver.h onfunctions.h onbody.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_MAT = virtualmatrix.cpp matrix.cpp matrixfun.cpp mat3x3.cpp virtualcolmatrix.cpp \
|
||||||
|
colmatrix.cpp vect3.cpp virtualrowmatrix.cpp rowmatrix.cpp mat6x6.cpp vect6.cpp \
|
||||||
|
fastmatrixops.cpp colmatmap.cpp eulerparameters.cpp vect4.cpp norm.cpp mat4x4.cpp \
|
||||||
|
|
||||||
|
INC_MAT = matrices.h virtualmatrix.h matrix.h matrixfun.h mat3x3.h virtualcolmatrix.h \
|
||||||
|
colmatrix.h vect3.h virtualrowmatrix.h rowmatrix.h mat6x6.h vect6.h \
|
||||||
|
fastmatrixops.h colmatmap.h eulerparameters.h vect4.h norm.h mat4x4.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC_MISC = poemstreenode.cpp
|
||||||
|
INC_MISC = poemslist.h poemstreenode.h poemstree.h poemsnodelib.h SystemProcessor.h defines.h POEMSChain.h
|
||||||
|
|
||||||
|
SRC = $(SRC_MAIN) $(SRC_BODY) $(SRC_JOINT) $(SRC_POINT) $(SRC_SOLVE) $(SRC_ORDERN) $(SRC_MAT) $(SRC_MISC)
|
||||||
|
INC = $(INC_MAIN) $(INC_BODY) $(INC_JOINT) $(INC_POINT) $(INC_SOLVE) $(INC_ORDERN) $(INC_MAT) $(INC_MISC)
|
||||||
|
|
||||||
|
FILES = $(SRC) $(INC) Makefile Authors_List.txt Grants_List.txt POEMS_License.txt README Copyright_Notice
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEFINITIONS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DIR = Obj_mingw64/
|
||||||
|
LIB = $(DIR)libpoems.a
|
||||||
|
OBJ = $(SRC:%.cpp=$(DIR)%.o)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ SETTINGS ------
|
||||||
|
|
||||||
|
CC = x86_64-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
CCFLAGS = -O2 -march=core2 -mtune=core2 -msse2 -mpc64 \
|
||||||
|
-ffast-math -funroll-loops -finline-functions -fno-rtti \
|
||||||
|
-fno-exceptions -fstrict-aliasing \
|
||||||
|
-Wall -W -Wno-uninitialized
|
||||||
|
ARCHIVE = x86_64-w64-mingw32-ar
|
||||||
|
ARCHFLAG = -rcs
|
||||||
|
DEPFLAGS = -M
|
||||||
|
LINK = x86_64-w64-mingw32-g++
|
||||||
|
LINKFLAGS = -O
|
||||||
|
USRLIB =
|
||||||
|
SYSLIB =
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ MAKE PROCEDURE ------
|
||||||
|
|
||||||
|
default: $(DIR) $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR):
|
||||||
|
-mkdir $(DIR)
|
||||||
|
|
||||||
|
$(LIB): $(OBJ)
|
||||||
|
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(LIB) $(OBJ)
|
||||||
|
@cp $(EXTRAMAKE) Makefile.lammps
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ COMPILE RULES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.o:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) -c $< -o $@
|
||||||
|
|
||||||
|
$(DIR)%.d:%.cpp
|
||||||
|
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ DEPENDENCIES ------
|
||||||
|
|
||||||
|
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
|
||||||
|
|
||||||
|
# ------ CLEAN ------
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
-rm $(DIR)*.o $(DIR)*.d *~ $(LIB)
|
||||||
|
|
||||||
|
tar:
|
||||||
|
-tar -cvf ../POEMS.tar $(FILES)
|
||||||
13
lib/poems/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
13
lib/poems/Makefile.mingw64-cross-mpi
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
# -*- makefile -*- wrapper for non-MPI libraries
|
||||||
|
|
||||||
|
SHELL=/bin/sh
|
||||||
|
|
||||||
|
all:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) mingw64-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
ln -s Obj_mingw64 Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) $(MFLAGS) clean-mingw64-cross
|
||||||
|
rm -f Obj_mingw64-mpi
|
||||||
|
|
||||||
Reference in New Issue
Block a user