diff --git a/lib/colvars/Makefile.fermi b/lib/colvars/Makefile.fermi index fe8d3ac16c..e17798bbc3 100644 --- a/lib/colvars/Makefile.fermi +++ b/lib/colvars/Makefile.fermi @@ -54,58 +54,62 @@ colvars_standalone: colvars_main.o colvarproxy_standalone.o $(LIB) # ------ DEPENDENCIES ------ # colvaratoms.o: colvaratoms.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarparse.h colvarvalue.h colvaratoms.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvaratoms.h colvarbias_abf.o: colvarbias_abf.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h colvarbias_abf.h \ - colvarbias.h colvargrid.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvarbias_abf.h colvarbias.h colvargrid.h colvarbias_alb.o: colvarbias_alb.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarbias_alb.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h \ - colvarbias_restraint.h colvarbias.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias_alb.h colvar.h colvarparse.h \ + colvardeps.h colvarbias_restraint.h colvarbias.h colvarbias.o: colvarbias.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h colvarbias_histogram.o: colvarbias_histogram.cpp colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h \ - colvarbias_histogram.h colvarbias.h colvargrid.h + colvardeps.h colvarbias_histogram.h colvarbias.h colvargrid.h colvarbias_meta.o: colvarbias_meta.cpp colvar.h colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ colvarbias_meta.h colvarbias.h colvargrid.h colvarbias_restraint.o: colvarbias_restraint.cpp colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias_restraint.h \ - colvarbias.h colvar.h colvarparse.h + colvarbias.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h colvarcomp_angles.o: colvarcomp_angles.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h colvarcomp.h \ - colvaratoms.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvarcomp.h colvaratoms.h colvarcomp_coordnums.o: colvarcomp_coordnums.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarparse.h colvarvalue.h colvaratoms.h \ - colvar.h colvarcomp.h + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvaratoms.h colvar.h colvarcomp.h colvarcomp.o: colvarcomp.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvarcomp.h colvaratoms.h -colvarcomp_distances.o: colvarcomp_distances.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h \ - colvarcomp.h colvaratoms.h -colvarcomp_protein.o: colvarcomp_protein.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h colvarcomp.h \ colvaratoms.h -colvarcomp_rotations.o: colvarcomp_rotations.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h \ +colvarcomp_distances.o: colvarcomp_distances.cpp colvarmodule.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h +colvarcomp_protein.o: colvarcomp_protein.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h \ colvarcomp.h colvaratoms.h +colvarcomp_rotations.o: colvarcomp_rotations.cpp colvarmodule.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h colvar.o: colvar.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h \ - colvarscript.h colvarbias.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvaratoms.h colvarscript.h colvarbias.h +colvardeps.o: colvardeps.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ + colvarvalue.h colvardeps.h colvargrid.o: colvargrid.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h \ - colvargrid.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvaratoms.h colvargrid.h colvarmodule.o: colvarmodule.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarbias.h \ - colvarbias_abf.h colvargrid.h colvarbias_alb.h colvarbias_restraint.h \ - colvarbias_histogram.h colvarbias_meta.h colvarscript.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h \ + colvarbias.h colvarbias_abf.h colvargrid.h colvarbias_alb.h \ + colvarbias_restraint.h colvarbias_histogram.h colvarbias_meta.h \ + colvarscript.h colvarparse.o: colvarparse.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvarscript.o: colvarscript.cpp colvarscript.h colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h \ - colvarbias.h + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h \ + colvarparse.h colvardeps.h colvartypes.o: colvartypes.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarparse.h colvarvalue.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvarvalue.o: colvarvalue.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ colvarvalue.h diff --git a/lib/colvars/Makefile.g++ b/lib/colvars/Makefile.g++ index d0fdd1c325..f1fa1734b9 100644 --- a/lib/colvars/Makefile.g++ +++ b/lib/colvars/Makefile.g++ @@ -53,58 +53,62 @@ colvars_standalone: colvars_main.o colvarproxy_standalone.o $(LIB) # ------ DEPENDENCIES ------ # colvaratoms.o: colvaratoms.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvaratoms.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvaratoms.h colvarbias_abf.o: colvarbias_abf.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvarbias_abf.h \ - colvarbias.h colvargrid.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvarbias_abf.h colvarbias.h colvargrid.h colvarbias_alb.o: colvarbias_alb.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias_alb.h colvar.h colvarparse.h \ - colvarbias_restraint.h colvarbias.h + colvardeps.h colvarbias_restraint.h colvarbias.h colvarbias.o: colvarbias.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h colvarbias_histogram.o: colvarbias_histogram.cpp colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h \ - colvarbias_histogram.h colvarbias.h colvargrid.h + colvardeps.h colvarbias_histogram.h colvarbias.h colvargrid.h colvarbias_meta.o: colvarbias_meta.cpp colvar.h colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ colvarbias_meta.h colvarbias.h colvargrid.h colvarbias_restraint.o: colvarbias_restraint.cpp colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias_restraint.h \ - colvarbias.h colvar.h colvarparse.h + colvarbias.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h colvarcomp_angles.o: colvarcomp_angles.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvarcomp.h \ - colvaratoms.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvarcomp.h colvaratoms.h colvarcomp_coordnums.o: colvarcomp_coordnums.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvaratoms.h \ - colvar.h colvarcomp.h + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvaratoms.h colvar.h colvarcomp.h colvarcomp.o: colvarcomp.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvarcomp.h colvaratoms.h -colvarcomp_distances.o: colvarcomp_distances.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h \ - colvarcomp.h colvaratoms.h -colvarcomp_protein.o: colvarcomp_protein.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h colvarcomp.h \ colvaratoms.h -colvarcomp_rotations.o: colvarcomp_rotations.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h \ +colvarcomp_distances.o: colvarcomp_distances.cpp colvarmodule.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h +colvarcomp_protein.o: colvarcomp_protein.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h \ colvarcomp.h colvaratoms.h +colvarcomp_rotations.o: colvarcomp_rotations.cpp colvarmodule.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h colvar.o: colvar.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h \ - colvarscript.h colvarbias.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvaratoms.h colvarscript.h colvarbias.h +colvardeps.o: colvardeps.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ + colvarvalue.h colvardeps.h colvargrid.o: colvargrid.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h \ - colvargrid.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvaratoms.h colvargrid.h colvarmodule.o: colvarmodule.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarbias.h \ - colvarbias_abf.h colvargrid.h colvarbias_alb.h colvarbias_restraint.h \ - colvarbias_histogram.h colvarbias_meta.h colvarscript.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h \ + colvarbias.h colvarbias_abf.h colvargrid.h colvarbias_alb.h \ + colvarbias_restraint.h colvarbias_histogram.h colvarbias_meta.h \ + colvarscript.h colvarparse.o: colvarparse.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvarscript.o: colvarscript.cpp colvarscript.h colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h \ - colvarparse.h + colvarparse.h colvardeps.h colvartypes.o: colvartypes.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvarvalue.o: colvarvalue.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ colvarvalue.h diff --git a/lib/colvars/Makefile.mingw32-cross b/lib/colvars/Makefile.mingw32-cross index 289b006a45..cea3a53c25 100644 --- a/lib/colvars/Makefile.mingw32-cross +++ b/lib/colvars/Makefile.mingw32-cross @@ -61,58 +61,62 @@ $(DIR)%.o: %.cpp # ------ DEPENDENCIES ------ # $(DIR)colvaratoms.o: colvaratoms.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarparse.h colvarvalue.h colvaratoms.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvaratoms.h $(DIR)colvarbias_abf.o: colvarbias_abf.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h colvarbias_abf.h \ - colvarbias.h colvargrid.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvarbias_abf.h colvarbias.h colvargrid.h $(DIR)colvarbias_alb.o: colvarbias_alb.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarbias_alb.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h \ - colvarbias_restraint.h colvarbias.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias_alb.h colvar.h colvarparse.h \ + colvardeps.h colvarbias_restraint.h colvarbias.h $(DIR)colvarbias.o: colvarbias.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvarbias_histogram.o: colvarbias_histogram.cpp colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h \ - colvarbias_histogram.h colvarbias.h colvargrid.h + colvardeps.h colvarbias_histogram.h colvarbias.h colvargrid.h $(DIR)colvarbias_meta.o: colvarbias_meta.cpp colvar.h colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ colvarbias_meta.h colvarbias.h colvargrid.h $(DIR)colvarbias_restraint.o: colvarbias_restraint.cpp colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias_restraint.h \ - colvarbias.h colvar.h colvarparse.h + colvarbias.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvarcomp_angles.o: colvarcomp_angles.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h colvarcomp.h \ - colvaratoms.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvarcomp.h colvaratoms.h $(DIR)colvarcomp_coordnums.o: colvarcomp_coordnums.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarparse.h colvarvalue.h colvaratoms.h \ - colvar.h colvarcomp.h + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvaratoms.h colvar.h colvarcomp.h $(DIR)colvarcomp.o: colvarcomp.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvarcomp.h colvaratoms.h -$(DIR)colvarcomp_distances.o: colvarcomp_distances.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h \ - colvarcomp.h colvaratoms.h -$(DIR)colvarcomp_protein.o: colvarcomp_protein.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h colvarcomp.h \ colvaratoms.h -$(DIR)colvarcomp_rotations.o: colvarcomp_rotations.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h \ +$(DIR)colvarcomp_distances.o: colvarcomp_distances.cpp colvarmodule.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h +$(DIR)colvarcomp_protein.o: colvarcomp_protein.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h \ colvarcomp.h colvaratoms.h +$(DIR)colvarcomp_rotations.o: colvarcomp_rotations.cpp colvarmodule.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h $(DIR)colvar.o: colvar.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h \ - colvarscript.h colvarbias.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvaratoms.h colvarscript.h colvarbias.h +$(DIR)colvardeps.o: colvardeps.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ + colvarvalue.h colvardeps.h $(DIR)colvargrid.o: colvargrid.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h \ - colvargrid.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvaratoms.h colvargrid.h $(DIR)colvarmodule.o: colvarmodule.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarbias.h \ - colvarbias_abf.h colvargrid.h colvarbias_alb.h colvarbias_restraint.h \ - colvarbias_histogram.h colvarbias_meta.h colvarscript.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h \ + colvarbias.h colvarbias_abf.h colvargrid.h colvarbias_alb.h \ + colvarbias_restraint.h colvarbias_histogram.h colvarbias_meta.h \ + colvarscript.h $(DIR)colvarparse.o: colvarparse.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvarscript.o: colvarscript.cpp colvarscript.h colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h \ - colvarbias.h + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h \ + colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvartypes.o: colvartypes.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarparse.h colvarvalue.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvarvalue.o: colvarvalue.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ colvarvalue.h diff --git a/lib/colvars/Makefile.mingw64-cross b/lib/colvars/Makefile.mingw64-cross index a6081273f8..7dd85b48f8 100644 --- a/lib/colvars/Makefile.mingw64-cross +++ b/lib/colvars/Makefile.mingw64-cross @@ -61,58 +61,62 @@ $(DIR)%.o: %.cpp # ------ DEPENDENCIES ------ # $(DIR)colvaratoms.o: colvaratoms.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarparse.h colvarvalue.h colvaratoms.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvaratoms.h $(DIR)colvarbias_abf.o: colvarbias_abf.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h colvarbias_abf.h \ - colvarbias.h colvargrid.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvarbias_abf.h colvarbias.h colvargrid.h $(DIR)colvarbias_alb.o: colvarbias_alb.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarbias_alb.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h \ - colvarbias_restraint.h colvarbias.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias_alb.h colvar.h colvarparse.h \ + colvardeps.h colvarbias_restraint.h colvarbias.h $(DIR)colvarbias.o: colvarbias.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvarbias_histogram.o: colvarbias_histogram.cpp colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h \ - colvarbias_histogram.h colvarbias.h colvargrid.h + colvardeps.h colvarbias_histogram.h colvarbias.h colvargrid.h $(DIR)colvarbias_meta.o: colvarbias_meta.cpp colvar.h colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ colvarbias_meta.h colvarbias.h colvargrid.h $(DIR)colvarbias_restraint.o: colvarbias_restraint.cpp colvarmodule.h \ colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias_restraint.h \ - colvarbias.h colvar.h colvarparse.h + colvarbias.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvarcomp_angles.o: colvarcomp_angles.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvar.h colvarvalue.h colvarparse.h colvarcomp.h \ - colvaratoms.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvarcomp.h colvaratoms.h $(DIR)colvarcomp_coordnums.o: colvarcomp_coordnums.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarparse.h colvarvalue.h colvaratoms.h \ - colvar.h colvarcomp.h + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvaratoms.h colvar.h colvarcomp.h $(DIR)colvarcomp.o: colvarcomp.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvarcomp.h colvaratoms.h -$(DIR)colvarcomp_distances.o: colvarcomp_distances.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h \ - colvarcomp.h colvaratoms.h -$(DIR)colvarcomp_protein.o: colvarcomp_protein.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h colvardeps.h colvarcomp.h \ colvaratoms.h -$(DIR)colvarcomp_rotations.o: colvarcomp_rotations.cpp colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h \ +$(DIR)colvarcomp_distances.o: colvarcomp_distances.cpp colvarmodule.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h +$(DIR)colvarcomp_protein.o: colvarcomp_protein.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h \ colvarcomp.h colvaratoms.h +$(DIR)colvarcomp_rotations.o: colvarcomp_rotations.cpp colvarmodule.h \ + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h \ + colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h $(DIR)colvar.o: colvar.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h \ - colvarscript.h colvarbias.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvaratoms.h colvarscript.h colvarbias.h +$(DIR)colvardeps.o: colvardeps.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ + colvarvalue.h colvardeps.h $(DIR)colvargrid.o: colvargrid.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarcomp.h colvaratoms.h \ - colvargrid.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h colvarcomp.h \ + colvaratoms.h colvargrid.h $(DIR)colvarmodule.o: colvarmodule.cpp colvarmodule.h colvartypes.h \ - colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvar.h colvarbias.h \ - colvarbias_abf.h colvargrid.h colvarbias_alb.h colvarbias_restraint.h \ - colvarbias_histogram.h colvarbias_meta.h colvarscript.h + colvarproxy.h colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h colvar.h \ + colvarbias.h colvarbias_abf.h colvargrid.h colvarbias_alb.h \ + colvarbias_restraint.h colvarbias_histogram.h colvarbias_meta.h \ + colvarscript.h $(DIR)colvarparse.o: colvarparse.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarvalue.h colvarparse.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvarscript.o: colvarscript.cpp colvarscript.h colvarmodule.h \ - colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvar.h colvarparse.h \ - colvarbias.h + colvartypes.h colvarproxy.h colvarvalue.h colvarbias.h colvar.h \ + colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvartypes.o: colvartypes.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ - colvarparse.h colvarvalue.h + colvarvalue.h colvarparse.h colvardeps.h $(DIR)colvarvalue.o: colvarvalue.cpp colvarmodule.h colvartypes.h colvarproxy.h \ colvarvalue.h