Added Python version of Zhou04_create_v2.f: create_eam.py and eamDatabase.py in tools/eam_database
This commit is contained in:
Germain Clavier
173
tools/eam_database/create_eam.py
Normal file
173
tools/eam_database/create_eam.py
Normal file
@ -0,0 +1,173 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env python3
|
||||||
|
# -*- coding: utf-8 -*-
|
||||||
|
|
||||||
|
"""
|
||||||
|
Python version of the code Zhou04_create_v2.f
|
||||||
|
original author: X. W. Zhou, xzhou@sandia.gov
|
||||||
|
based on updates by: Lucas Hale lucas.hale@nist.gov
|
||||||
|
written by: Germain Clavier g.m.g.c.clavier@tue.nl
|
||||||
|
This script requires the numpy library.
|
||||||
|
"""
|
||||||
|
|
||||||
|
import sys
|
||||||
|
import argparse as ap
|
||||||
|
import numpy as np
|
||||||
|
from eamDatabase import Database
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
def prof(at, r):
|
||||||
|
atom = Database[at]
|
||||||
|
f = np.zeros(r.shape)
|
||||||
|
f = atom.fe * np.exp(-atom.beta1 * (r[r >= 0.5] / atom.re - 1.0))
|
||||||
|
f = f / (1.0 + (r / atom.re - atom.ramda1) ** 20)
|
||||||
|
return f
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
def pair(at1, at2, r):
|
||||||
|
atom = Database[at1]
|
||||||
|
psi1 = atom.A * np.exp(-atom.alpha * (r / atom.re - 1.0))
|
||||||
|
psi1 /= 1.0 + (r / atom.re - atom.cai) ** 20
|
||||||
|
psi2 = atom.B * np.exp(-atom.beta * (r / atom.re - 1.0))
|
||||||
|
psi2 /= 1.0 + (r / atom.re - atom.ramda) ** 20
|
||||||
|
if at1 == at2:
|
||||||
|
psi = psi1 - psi2
|
||||||
|
else:
|
||||||
|
psia = psi1 - psi2
|
||||||
|
atom2 = Database[at2]
|
||||||
|
psi1 = atom2.A * np.exp(-atom2.alpha * (r / atom2.re - 1.0))
|
||||||
|
psi1 /= 1.0 + (r / atom2.re - atom2.cai) ** 20
|
||||||
|
psi2 = atom2.B * np.exp(-atom2.beta * (r / atom2.re - 1.0))
|
||||||
|
psi2 /= 1.0 + (r / atom2.re - atom2.ramda) ** 20
|
||||||
|
psib = psi1 - psi2
|
||||||
|
prof1 = prof(at1, r)
|
||||||
|
prof2 = prof(at2, r)
|
||||||
|
psi = 0.5 * (prof2 / prof1 * psia + prof1 / prof2 * psib)
|
||||||
|
return psi
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
def embed(at, rho):
|
||||||
|
atom = Database[at]
|
||||||
|
Fm33 = np.zeros(rho.shape)
|
||||||
|
Fm33[rho < atom.rhoe] = atom.Fm3
|
||||||
|
Fm33[rho >= atom.rhoe] = atom.Fm4
|
||||||
|
emb = np.zeros(rho.shape)
|
||||||
|
for i, r in enumerate(rho):
|
||||||
|
if r == 0:
|
||||||
|
emb[i] = 0
|
||||||
|
elif r < atom.rhoin:
|
||||||
|
dr = r / atom.rhoin - 1
|
||||||
|
emb[i] = atom.Fi0 + atom.Fi1 * dr + atom.Fi2 * dr**2 + atom.Fi3 * dr**3
|
||||||
|
elif r < atom.rhoout:
|
||||||
|
dr = r / atom.rhoe - 1
|
||||||
|
emb[i] = atom.Fm0 + atom.Fm1 * dr + atom.Fm2 * dr**2 + Fm33[i] * dr**3
|
||||||
|
else:
|
||||||
|
dr = r / atom.rhos
|
||||||
|
emb[i] = atom.Fn * (1.0 - atom.fnn * np.log(dr)) * dr**atom.fnn
|
||||||
|
return emb
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
def write_file(attypes, filename, Fr, rhor, z2r, nrho, drho, nr, dr, rc):
|
||||||
|
struc = "fcc"
|
||||||
|
with open(filename, "w") as f:
|
||||||
|
f.write("DATE: 2022-02-11")
|
||||||
|
f.write(" CONTRIBUTORS: Xiaowang Zhou xzhou@sandia.gov and")
|
||||||
|
f.write(" Lucas Hale lucas.hale@nist.gov")
|
||||||
|
f.write(" Germain Clavier g.m.g.c.clavier@tue.nl/germain.clavier@gmail.com\n")
|
||||||
|
f.write(" CITATION: X. W. Zhou, R. A. Johnson, H. N. G. Wadley, Phys. Rev. B, 69, 144113(2004)\n")
|
||||||
|
f.write("Generated from create_eam.py, Python version of Zhou04_create_v2.f\n")
|
||||||
|
f.write("{:<5d} {:<24}\n".format(len(attypes), " ".join(attypes)))
|
||||||
|
f.write(
|
||||||
|
"{:<5d} {:<24.16e} {:<5d} {:<24.16e} {:<24.16e}\n".format(
|
||||||
|
nrho, drho, nr, dr, rc
|
||||||
|
)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
for at in attypes:
|
||||||
|
atom = Database[at]
|
||||||
|
f.write(
|
||||||
|
"{:>5d} {:>15.5f} {:>15.5f} {:>8}\n".format(
|
||||||
|
atom.ielement, atom.amass, atom.blat, struc
|
||||||
|
)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
for i, fr in enumerate(Fr[at]):
|
||||||
|
f.write(" {:>24.16E}".format(fr))
|
||||||
|
if not (i + 1) % 5:
|
||||||
|
f.write("\n")
|
||||||
|
for i, rho in enumerate(rhor[at]):
|
||||||
|
f.write(" {:>24.16E}".format(rho))
|
||||||
|
if not (i + 1) % 5:
|
||||||
|
f.write("\n")
|
||||||
|
for n1 in range(len(attypes)):
|
||||||
|
for n2 in range(n1 + 1):
|
||||||
|
for i, z in enumerate(z2r[n1, n2]):
|
||||||
|
f.write(" {:>24.16E}".format(z))
|
||||||
|
if not (i + 1) % 5:
|
||||||
|
f.write("\n")
|
||||||
|
|
||||||
|
return
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
def main():
|
||||||
|
|
||||||
|
parser = ap.ArgumentParser(description="Script to make EAM alloy file inputs.")
|
||||||
|
parser.add_argument("-n", "--names", dest="names", nargs="+", help="Atom names.")
|
||||||
|
parser.add_argument("-nr", dest="nr", type=int, default=2000, help="Number of point in r space [default 2000].")
|
||||||
|
parser.add_argument("-nrho", dest="nrho", type=int, default=2000, help="Number of point in rho space [default 2000].")
|
||||||
|
args = parser.parse_args()
|
||||||
|
atnames = args.names
|
||||||
|
nr = args.nr
|
||||||
|
nrho = args.nrho
|
||||||
|
|
||||||
|
for n in atnames:
|
||||||
|
try:
|
||||||
|
Database[n]
|
||||||
|
except KeyError:
|
||||||
|
output = "Atom {} not found.\n".format(n)
|
||||||
|
valid = "Valid inputs are: {}".format(" ".join(Database.keys()))
|
||||||
|
sys.exit("".join([output, valid]))
|
||||||
|
|
||||||
|
ntypes = len(atnames)
|
||||||
|
outfilename = "".join([*atnames, ".set"])
|
||||||
|
rhor = {}
|
||||||
|
Fr = {}
|
||||||
|
|
||||||
|
alatmax = max([Database[at].blat for at in atnames])
|
||||||
|
rhoemax = max([Database[at].rhoe for at in atnames])
|
||||||
|
rc = np.sqrt(10.0) / 2.0 * alatmax
|
||||||
|
rst = 0.5
|
||||||
|
r = np.linspace(0.0, rc, num=nr, dtype=np.double)
|
||||||
|
dr = r[1] - r[0]
|
||||||
|
r[r < rst] = rst
|
||||||
|
z2r = np.zeros([ntypes, ntypes, nr])
|
||||||
|
fmax = -np.inf
|
||||||
|
rhomax = -np.inf
|
||||||
|
|
||||||
|
for i, n1 in enumerate(atnames):
|
||||||
|
for j, n2 in enumerate(atnames):
|
||||||
|
if j > i:
|
||||||
|
continue
|
||||||
|
elif i == j:
|
||||||
|
rhor[n1] = prof(n1, r)
|
||||||
|
rhomax = np.max(rhor[n1]) if rhomax < np.max(rhor[n1]) else rhomax
|
||||||
|
z2r[i, j, :] = r * pair(n1, n2, r)
|
||||||
|
else:
|
||||||
|
z2r[i, j, :] = r * pair(n1, n2, r)
|
||||||
|
z2r = np.where(z2r, z2r, z2r.transpose((1, 0, 2)))
|
||||||
|
if rhomax < 2.0 * rhoemax:
|
||||||
|
rhomax = 2.0 * rhoemax
|
||||||
|
if rhomax < 100.0:
|
||||||
|
rhomax = 100.0
|
||||||
|
rho = np.linspace(0.0, rhomax, num=nrho, dtype=np.double)
|
||||||
|
drho = rho[1] - rho[0]
|
||||||
|
for i, n1 in enumerate(atnames):
|
||||||
|
Fr[n1] = embed(n1, rho)
|
||||||
|
|
||||||
|
write_file(atnames, outfilename, Fr, rhor, z2r, nrho, drho, nr, dr, rc)
|
||||||
|
|
||||||
|
return
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
if __name__ == "__main__":
|
||||||
|
try:
|
||||||
|
main()
|
||||||
|
except KeyboardInterrupt:
|
||||||
|
raise SystemExit("User interruption.")
|
||||||
610
tools/eam_database/eamDatabase.py
Normal file
610
tools/eam_database/eamDatabase.py
Normal file
@ -0,0 +1,610 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env python3
|
||||||
|
# -*- coding: utf-8 -*-
|
||||||
|
|
||||||
|
"""
|
||||||
|
Python version of the code Zhou04_create_v2.f
|
||||||
|
original author: X. W. Zhou, xzhou@sandia.gov
|
||||||
|
based on updates by: Lucas Hale lucas.hale@nist.gov
|
||||||
|
written by: Germain Clavier g.m.g.c.clavier@tue.nl
|
||||||
|
|
||||||
|
This file contains atom attributes for the EAM model and alloy combination. The
|
||||||
|
original file is EAM_code. It is designed to be used with create_eam.py script.
|
||||||
|
To add new contribution, just add new AtType instances.
|
||||||
|
"""
|
||||||
|
|
||||||
|
import math
|
||||||
|
|
||||||
|
class AtType:
|
||||||
|
def __init__(
|
||||||
|
self,
|
||||||
|
name,
|
||||||
|
re,
|
||||||
|
fe,
|
||||||
|
rhoe,
|
||||||
|
rhos,
|
||||||
|
alpha,
|
||||||
|
beta,
|
||||||
|
A,
|
||||||
|
B,
|
||||||
|
cai,
|
||||||
|
ramda,
|
||||||
|
Fi0,
|
||||||
|
Fi1,
|
||||||
|
Fi2,
|
||||||
|
Fi3,
|
||||||
|
Fm0,
|
||||||
|
Fm1,
|
||||||
|
Fm2,
|
||||||
|
Fm3,
|
||||||
|
fnn,
|
||||||
|
Fn,
|
||||||
|
ielement,
|
||||||
|
amass,
|
||||||
|
Fm4,
|
||||||
|
beta1,
|
||||||
|
ramda1,
|
||||||
|
rhol,
|
||||||
|
rhoh,
|
||||||
|
):
|
||||||
|
self.name = name
|
||||||
|
self.re = re
|
||||||
|
self.fe = fe
|
||||||
|
self.rhoe = rhoe
|
||||||
|
self.rhos = rhos
|
||||||
|
self.alpha = alpha
|
||||||
|
self.beta = beta
|
||||||
|
self.A = A
|
||||||
|
self.B = B
|
||||||
|
self.cai = cai
|
||||||
|
self.ramda = ramda
|
||||||
|
self.Fi0 = Fi0
|
||||||
|
self.Fi1 = Fi1
|
||||||
|
self.Fi2 = Fi2
|
||||||
|
self.Fi3 = Fi3
|
||||||
|
self.Fm0 = Fm0
|
||||||
|
self.Fm1 = Fm1
|
||||||
|
self.Fm2 = Fm2
|
||||||
|
self.Fm3 = Fm3
|
||||||
|
self.fnn = fnn
|
||||||
|
self.Fn = Fn
|
||||||
|
self.ielement = ielement
|
||||||
|
self.amass = amass
|
||||||
|
self.Fm4 = Fm4
|
||||||
|
self.beta1 = beta1
|
||||||
|
self.ramda1 = ramda1
|
||||||
|
self.rhol = rhol
|
||||||
|
self.rhoh = rhoh
|
||||||
|
self.blat = math.sqrt(2.0) * self.re
|
||||||
|
self.rhoin = self.rhol * self.rhoe
|
||||||
|
self.rhoout = self.rhoh * self.rhoe
|
||||||
|
|
||||||
|
def __repr__(self):
|
||||||
|
output = """{}:
|
||||||
|
re = {}; fe = {}
|
||||||
|
rhoe = {}; rhos = {};
|
||||||
|
alpha = {}; beta = {};
|
||||||
|
A = {}; B = {}
|
||||||
|
cai = {}; ramda = {}
|
||||||
|
Fi0 = {}; Fi1 = {}; Fi2 = {}; Fi3 = {}
|
||||||
|
Fm0 = {}; Fm1 = {}; Fm2 = {}; Fm3 = {}; Fm4 = {}
|
||||||
|
fnn = {}; Fn = {}
|
||||||
|
ielement = {}; amass = {}
|
||||||
|
beta1 = {}; ramda1 = {}
|
||||||
|
rhol = {}; rhoh = {}
|
||||||
|
blat = {}; rhoin = {}; rhoout = {}"""
|
||||||
|
return output.format(
|
||||||
|
self.name,
|
||||||
|
self.re,
|
||||||
|
self.fe,
|
||||||
|
self.rhoe,
|
||||||
|
self.rhos,
|
||||||
|
self.alpha,
|
||||||
|
self.beta,
|
||||||
|
self.A,
|
||||||
|
self.B,
|
||||||
|
self.cai,
|
||||||
|
self.ramda,
|
||||||
|
self.Fi0,
|
||||||
|
self.Fi1,
|
||||||
|
self.Fi2,
|
||||||
|
self.Fi3,
|
||||||
|
self.Fm0,
|
||||||
|
self.Fm1,
|
||||||
|
self.Fm2,
|
||||||
|
self.Fm3,
|
||||||
|
self.Fm4,
|
||||||
|
self.fnn,
|
||||||
|
self.Fn,
|
||||||
|
self.ielement,
|
||||||
|
self.amass,
|
||||||
|
self.beta1,
|
||||||
|
self.ramda1,
|
||||||
|
self.rhol,
|
||||||
|
self.rhoh,
|
||||||
|
self.blat,
|
||||||
|
self.rhoin,
|
||||||
|
self.rhoout,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Database = {}
|
||||||
|
Database["Cu"] = AtType(
|
||||||
|
"Cu", # Name
|
||||||
|
2.556162, # re
|
||||||
|
1.554485, # fe
|
||||||
|
21.175871, # rhoe
|
||||||
|
21.175395, # rhos
|
||||||
|
8.127620, # alpha
|
||||||
|
4.334731, # beta
|
||||||
|
0.396620, # A
|
||||||
|
0.548085, # B
|
||||||
|
0.308782, # cai
|
||||||
|
0.756515, # ramda
|
||||||
|
-2.170269, # Fi0
|
||||||
|
-0.263788, # Fi1
|
||||||
|
1.088878, # Fi2
|
||||||
|
-0.817603, # Fi3
|
||||||
|
-2.19, # Fm0
|
||||||
|
0.00, # Fm1
|
||||||
|
0.561830, # Fm2
|
||||||
|
-2.100595, # Fm3
|
||||||
|
0.310490, # fnn
|
||||||
|
-2.186568, # Fn
|
||||||
|
29, # ielement
|
||||||
|
63.546, # amass
|
||||||
|
-2.100595, # Fm4
|
||||||
|
4.334731, # beta1
|
||||||
|
0.756515, # ramda1
|
||||||
|
0.85, # rhol
|
||||||
|
1.15, # rhoh
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Ag"] = AtType(
|
||||||
|
"Ag",
|
||||||
|
2.891814,
|
||||||
|
1.106232,
|
||||||
|
14.604100,
|
||||||
|
14.604144,
|
||||||
|
9.132010,
|
||||||
|
4.870405,
|
||||||
|
0.277758,
|
||||||
|
0.419611,
|
||||||
|
0.339710,
|
||||||
|
0.750758,
|
||||||
|
-1.729364,
|
||||||
|
-0.255882,
|
||||||
|
0.912050,
|
||||||
|
-0.561432,
|
||||||
|
-1.75,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.744561,
|
||||||
|
-1.150650,
|
||||||
|
0.783924,
|
||||||
|
-1.748423,
|
||||||
|
47,
|
||||||
|
107.8682,
|
||||||
|
-1.150650,
|
||||||
|
4.870405,
|
||||||
|
0.750758,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Au"] = AtType(
|
||||||
|
"Au",
|
||||||
|
2.885034,
|
||||||
|
1.529021,
|
||||||
|
19.991632,
|
||||||
|
19.991509,
|
||||||
|
9.516052,
|
||||||
|
5.075228,
|
||||||
|
0.229762,
|
||||||
|
0.356666,
|
||||||
|
0.356570,
|
||||||
|
0.748798,
|
||||||
|
-2.937772,
|
||||||
|
-0.500288,
|
||||||
|
1.601954,
|
||||||
|
-0.835530,
|
||||||
|
-2.98,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
1.706587,
|
||||||
|
-1.134778,
|
||||||
|
1.021095,
|
||||||
|
-2.978815,
|
||||||
|
79,
|
||||||
|
196.96654,
|
||||||
|
-1.134778,
|
||||||
|
5.075228,
|
||||||
|
0.748798,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Ni"] = AtType(
|
||||||
|
"Ni",
|
||||||
|
2.488746,
|
||||||
|
2.007018,
|
||||||
|
27.562015,
|
||||||
|
27.562031,
|
||||||
|
8.383453,
|
||||||
|
4.471175,
|
||||||
|
0.429046,
|
||||||
|
0.633531,
|
||||||
|
0.443599,
|
||||||
|
0.820658,
|
||||||
|
-2.693513,
|
||||||
|
-0.076445,
|
||||||
|
0.241442,
|
||||||
|
-2.375626,
|
||||||
|
-2.70,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.265390,
|
||||||
|
-0.152856,
|
||||||
|
0.445470,
|
||||||
|
-2.7,
|
||||||
|
28,
|
||||||
|
58.6934,
|
||||||
|
-0.152856,
|
||||||
|
4.471175,
|
||||||
|
0.820658,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Pd"] = AtType(
|
||||||
|
"Pd",
|
||||||
|
2.750897,
|
||||||
|
1.595417,
|
||||||
|
21.335246,
|
||||||
|
21.940073,
|
||||||
|
8.697397,
|
||||||
|
4.638612,
|
||||||
|
0.406763,
|
||||||
|
0.598880,
|
||||||
|
0.397263,
|
||||||
|
0.754799,
|
||||||
|
-2.321006,
|
||||||
|
-0.473983,
|
||||||
|
1.615343,
|
||||||
|
-0.231681,
|
||||||
|
-2.36,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
1.481742,
|
||||||
|
-1.675615,
|
||||||
|
1.130000,
|
||||||
|
-2.352753,
|
||||||
|
46,
|
||||||
|
106.42,
|
||||||
|
-1.675615,
|
||||||
|
4.638612,
|
||||||
|
0.754799,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Pt"] = AtType(
|
||||||
|
"Pt",
|
||||||
|
2.771916,
|
||||||
|
2.336509,
|
||||||
|
33.367564,
|
||||||
|
35.205357,
|
||||||
|
7.105782,
|
||||||
|
3.789750,
|
||||||
|
0.556398,
|
||||||
|
0.696037,
|
||||||
|
0.385255,
|
||||||
|
0.770510,
|
||||||
|
-1.455568,
|
||||||
|
-2.149952,
|
||||||
|
0.528491,
|
||||||
|
1.222875,
|
||||||
|
-4.17,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
3.010561,
|
||||||
|
-2.420128,
|
||||||
|
1.450000,
|
||||||
|
-4.145597,
|
||||||
|
78,
|
||||||
|
195.08,
|
||||||
|
-2.420128,
|
||||||
|
3.789750,
|
||||||
|
0.770510,
|
||||||
|
0.25,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Al"] = AtType(
|
||||||
|
"Al",
|
||||||
|
2.863924,
|
||||||
|
1.403115,
|
||||||
|
20.418205,
|
||||||
|
23.195740,
|
||||||
|
6.613165,
|
||||||
|
3.527021,
|
||||||
|
0.314873,
|
||||||
|
0.365551,
|
||||||
|
0.379846,
|
||||||
|
0.759692,
|
||||||
|
-2.807602,
|
||||||
|
-0.301435,
|
||||||
|
1.258562,
|
||||||
|
-1.247604,
|
||||||
|
-2.83,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.622245,
|
||||||
|
-2.488244,
|
||||||
|
0.785902,
|
||||||
|
-2.824528,
|
||||||
|
13,
|
||||||
|
26.981539,
|
||||||
|
-2.488244,
|
||||||
|
3.527021,
|
||||||
|
0.759692,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Pb"] = AtType(
|
||||||
|
"Pb",
|
||||||
|
3.499723,
|
||||||
|
0.647872,
|
||||||
|
8.450154,
|
||||||
|
8.450063,
|
||||||
|
9.121799,
|
||||||
|
5.212457,
|
||||||
|
0.161219,
|
||||||
|
0.236884,
|
||||||
|
0.250805,
|
||||||
|
0.764955,
|
||||||
|
-1.422370,
|
||||||
|
-0.210107,
|
||||||
|
0.682886,
|
||||||
|
-0.529378,
|
||||||
|
-1.44,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.702726,
|
||||||
|
-0.538766,
|
||||||
|
0.935380,
|
||||||
|
-1.439436,
|
||||||
|
82,
|
||||||
|
207.2,
|
||||||
|
-0.538766,
|
||||||
|
5.212457,
|
||||||
|
0.764955,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Fe"] = AtType(
|
||||||
|
"Fe",
|
||||||
|
2.481987,
|
||||||
|
1.885957,
|
||||||
|
20.041463,
|
||||||
|
20.041463,
|
||||||
|
9.818270,
|
||||||
|
5.236411,
|
||||||
|
0.392811,
|
||||||
|
0.646243,
|
||||||
|
0.170306,
|
||||||
|
0.340613,
|
||||||
|
-2.534992,
|
||||||
|
-0.059605,
|
||||||
|
0.193065,
|
||||||
|
-2.282322,
|
||||||
|
-2.54,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.200269,
|
||||||
|
-0.148770,
|
||||||
|
0.391750,
|
||||||
|
-2.539945,
|
||||||
|
26,
|
||||||
|
55.847,
|
||||||
|
-0.148770,
|
||||||
|
5.236411,
|
||||||
|
0.340613,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Mo"] = AtType(
|
||||||
|
"Mo",
|
||||||
|
2.728100,
|
||||||
|
2.723710,
|
||||||
|
29.354065,
|
||||||
|
29.354065,
|
||||||
|
8.393531,
|
||||||
|
4.476550,
|
||||||
|
0.708787,
|
||||||
|
1.120373,
|
||||||
|
0.137640,
|
||||||
|
0.275280,
|
||||||
|
-3.692913,
|
||||||
|
-0.178812,
|
||||||
|
0.380450,
|
||||||
|
-3.133650,
|
||||||
|
-3.71,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.875874,
|
||||||
|
0.776222,
|
||||||
|
0.790879,
|
||||||
|
-3.712093,
|
||||||
|
42,
|
||||||
|
95.94,
|
||||||
|
0.776222,
|
||||||
|
4.476550,
|
||||||
|
0.275280,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Ta"] = AtType(
|
||||||
|
"Ta",
|
||||||
|
2.860082,
|
||||||
|
3.086341,
|
||||||
|
33.787168,
|
||||||
|
33.787168,
|
||||||
|
8.489528,
|
||||||
|
4.527748,
|
||||||
|
0.611679,
|
||||||
|
1.032101,
|
||||||
|
0.176977,
|
||||||
|
0.353954,
|
||||||
|
-5.103845,
|
||||||
|
-0.405524,
|
||||||
|
1.112997,
|
||||||
|
-3.585325,
|
||||||
|
-5.14,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
1.640098,
|
||||||
|
0.221375,
|
||||||
|
0.848843,
|
||||||
|
-5.141526,
|
||||||
|
73,
|
||||||
|
180.9479,
|
||||||
|
0.221375,
|
||||||
|
4.527748,
|
||||||
|
0.353954,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["W"] = AtType(
|
||||||
|
"W",
|
||||||
|
2.740840,
|
||||||
|
3.487340,
|
||||||
|
37.234847,
|
||||||
|
37.234847,
|
||||||
|
8.900114,
|
||||||
|
4.746728,
|
||||||
|
0.882435,
|
||||||
|
1.394592,
|
||||||
|
0.139209,
|
||||||
|
0.278417,
|
||||||
|
-4.946281,
|
||||||
|
-0.148818,
|
||||||
|
0.365057,
|
||||||
|
-4.432406,
|
||||||
|
-4.96,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.661935,
|
||||||
|
0.348147,
|
||||||
|
0.582714,
|
||||||
|
-4.961306,
|
||||||
|
74,
|
||||||
|
183.84,
|
||||||
|
0.348147,
|
||||||
|
4.746728,
|
||||||
|
0.278417,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Mg"] = AtType(
|
||||||
|
"Mg",
|
||||||
|
3.196291,
|
||||||
|
0.544323,
|
||||||
|
7.132600,
|
||||||
|
7.132600,
|
||||||
|
10.228708,
|
||||||
|
5.455311,
|
||||||
|
0.137518,
|
||||||
|
0.225930,
|
||||||
|
0.5,
|
||||||
|
1.0,
|
||||||
|
-0.896473,
|
||||||
|
-0.044291,
|
||||||
|
0.162232,
|
||||||
|
-0.689950,
|
||||||
|
-0.90,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.122838,
|
||||||
|
-0.226010,
|
||||||
|
0.431425,
|
||||||
|
-0.899702,
|
||||||
|
12,
|
||||||
|
24.305,
|
||||||
|
-0.226010,
|
||||||
|
5.455311,
|
||||||
|
1.0,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Co"] = AtType(
|
||||||
|
"Co",
|
||||||
|
2.505979,
|
||||||
|
1.975299,
|
||||||
|
27.206789,
|
||||||
|
27.206789,
|
||||||
|
8.679625,
|
||||||
|
4.629134,
|
||||||
|
0.421378,
|
||||||
|
0.640107,
|
||||||
|
0.5,
|
||||||
|
1.0,
|
||||||
|
-2.541799,
|
||||||
|
-0.219415,
|
||||||
|
0.733381,
|
||||||
|
-1.589003,
|
||||||
|
-2.56,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.705845,
|
||||||
|
-0.687140,
|
||||||
|
0.694608,
|
||||||
|
-2.559307,
|
||||||
|
27,
|
||||||
|
58.9332,
|
||||||
|
-0.687140,
|
||||||
|
4.629134,
|
||||||
|
1.0,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Ti"] = AtType(
|
||||||
|
"Ti",
|
||||||
|
2.933872,
|
||||||
|
1.863200,
|
||||||
|
25.565138,
|
||||||
|
25.565138,
|
||||||
|
8.775431,
|
||||||
|
4.680230,
|
||||||
|
0.373601,
|
||||||
|
0.570968,
|
||||||
|
0.5,
|
||||||
|
1.0,
|
||||||
|
-3.203773,
|
||||||
|
-0.198262,
|
||||||
|
0.683779,
|
||||||
|
-2.321732,
|
||||||
|
-3.22,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.608587,
|
||||||
|
-0.750710,
|
||||||
|
0.558572,
|
||||||
|
-3.219176,
|
||||||
|
22,
|
||||||
|
47.88,
|
||||||
|
-0.750710,
|
||||||
|
4.680230,
|
||||||
|
1.0,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
|
Database["Zr"] = AtType(
|
||||||
|
"Zr",
|
||||||
|
3.199978,
|
||||||
|
2.230909,
|
||||||
|
30.879991,
|
||||||
|
30.879991,
|
||||||
|
8.559190,
|
||||||
|
4.564902,
|
||||||
|
0.424667,
|
||||||
|
0.640054,
|
||||||
|
0.5,
|
||||||
|
1.0,
|
||||||
|
-4.485793,
|
||||||
|
-0.293129,
|
||||||
|
0.990148,
|
||||||
|
-3.202516,
|
||||||
|
-4.51,
|
||||||
|
0.00,
|
||||||
|
0.928602,
|
||||||
|
-0.981870,
|
||||||
|
0.597133,
|
||||||
|
-4.509025,
|
||||||
|
40,
|
||||||
|
91.224,
|
||||||
|
-0.981870,
|
||||||
|
4.564902,
|
||||||
|
1.0,
|
||||||
|
0.85,
|
||||||
|
1.15,
|
||||||
|
)
|
||||||
Reference in New Issue
Block a user