############################################################################### # MD simulation for HDNNP water ############################################################################### ############################################################################### # VARIABLES ############################################################################### clear # Configuration files variable cfgFile string "data.H2O-360mol" # Timesteps variable numSteps equal 10 variable dt equal 0.0005 # HDNNP variable hdnnpCutoff equal 6.36 variable hdnnpDir string "hdnnp-data" ############################################################################### # GENERAL SETUP ############################################################################### units metal boundary p p p atom_style atomic read_data ${cfgFile} timestep ${dt} thermo 1 ############################################################################### # HDNNP ############################################################################### pair_style hdnnp ${hdnnpCutoff} dir ${hdnnpDir} showew no showewsum 5 resetew no maxew 100 cflength 1.8897261328 cfenergy 0.0367493254 pair_coeff * * H O ############################################################################### # INTEGRATOR ############################################################################### fix INT all nve ############################################################################### # OUTPUT ############################################################################### # dump 1 all atom 1 dump.hdnnp ############################################################################### # SIMULATION ############################################################################### run ${numSteps}