LAMMPS (7 Aug 2019) Running on 16 partitions of processors Setting up tempering ... 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2 5 4 7 6 9 8 11 10 13 12 15 14 1880 2 0 4 1 6 3 8 5 10 7 12 9 14 11 15 13 1890 3 1 5 0 7 2 9 4 11 6 13 8 15 10 14 12 1900 4 2 6 0 8 1 10 3 12 5 14 7 15 9 13 11 1910 3 1 5 0 7 2 9 4 11 6 13 8 15 10 14 12 1920 2 0 4 1 6 3 8 5 10 7 12 9 14 11 15 13 1930 1 0 3 2 5 4 7 6 9 8 11 10 13 12 15 14 1940 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 1950 0 2 1 4 3 6 5 8 7 10 9 12 11 14 13 15 1960 1 3 0 5 2 7 4 9 6 11 8 13 10 15 12 14 1970 2 4 0 6 1 8 3 10 5 12 7 14 9 15 11 13 1980 3 5 1 7 0 9 2 11 4 13 6 15 8 14 10 12 1990 2 4 0 6 1 8 3 10 5 12 7 14 9 15 11 13 2000 1 3 0 5 2 7 4 9 6 11 8 13 10 15 12 14 Parsing energies from replica logs Getting frames from all replicas at temperature: 200.00 K 209.00 K 219.00 K 230.00 K 241.00 K 252.00 K 264.00 K 276.00 K 289.00 K 303.00 K 317.00 K 332.00 K 348.00 K 365.00 K 382.00 K 400.00 K Releasing 13 excess procs Writing buffer to file Running pymbar... K (total states) = 16, total samples = 800 N_k = [50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50] There are 16 states with samples. Initializing free energies to zero. Initial dimensionless free energies with method zeros f_k = [0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0.] Final dimensionless free energies f_k = [ 0. 889.75988663 1792.61111609 2695.06980154 3515.14636632 4263.62894529 5009.01862104 5689.59180324 6363.10021193 7023.7847743 7626.11234062 8215.09228661 8787.37318432 9340.44739436 9844.29510404 10331.10090589] MBAR initialization complete. Extracting log-weights...