ee240f93d9
Cutoff radius is now mandatory argument of pair_style. "emap" keyword is removed and replaced by additional pair_coeff arguments (similar to pair_airebo.cpp). Changes in docs are still missing.
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# MD simulation for HDNNP water
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# VARIABLES
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clear
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# Configuration files
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variable cfgFile string "data.H2O-360mol"
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# Timesteps
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variable numSteps equal 10
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variable dt equal 0.0005
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# HDNNP
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variable hdnnpCutoff equal 6.36
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variable hdnnpDir string "hdnnp-data"
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# GENERAL SETUP
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units metal
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boundary p p p
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atom_style atomic
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read_data ${cfgFile}
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timestep ${dt}
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thermo 1
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# HDNNP
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pair_style hdnnp ${hdnnpCutoff} dir ${hdnnpDir} showew no showewsum 5 resetew no maxew 100 cflength 1.8897261328 cfenergy 0.0367493254
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pair_coeff * * H O
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# INTEGRATOR
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fix INT all nve
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# OUTPUT
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dump 1 all atom 1 dump.hdnnp
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# SIMULATION
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run ${numSteps}
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