rerun logfiles for USER-UEF example inputs
This commit is contained in:
Axel Kohlmeyer
@ -52,233 +52,233 @@ Neighbor list info ...
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Per MPI rank memory allocation (min/avg/max) = 2.742 | 2.742 | 2.742 Mbytes
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Step c_1_press[1] c_1_press[2] c_1_press[3]
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|
||||
8550 7.1928433 6.8056774 13.691643
|
||||
8600 7.0377566 7.3074361 14.141988
|
||||
8650 7.3824217 7.4739032 14.679069
|
||||
8700 7.7684482 8.1554503 15.191035
|
||||
8750 7.9590885 8.1135479 14.338724
|
||||
8800 8.1231133 7.7860088 15.403904
|
||||
8850 8.5000448 8.1024052 15.173116
|
||||
8900 7.3845853 7.9495964 14.619746
|
||||
8950 7.5818306 7.2248015 14.621207
|
||||
9000 7.2164673 6.6633348 15.609622
|
||||
9050 7.5851603 8.0836264 15.022988
|
||||
9100 7.8771779 7.6350639 14.077462
|
||||
9150 7.6077035 6.8475422 14.315993
|
||||
9200 7.6583735 7.5077759 14.569883
|
||||
9250 7.5263046 7.7028057 14.57854
|
||||
9300 7.2162602 8.053893 16.02041
|
||||
9350 8.3756477 8.1996826 14.70403
|
||||
9400 7.7634122 7.5041574 13.936959
|
||||
9450 7.3067071 7.7438443 14.542518
|
||||
9500 7.4048127 7.44049 14.821218
|
||||
9550 7.2884669 7.9974016 14.367535
|
||||
9600 7.4198667 7.9510424 15.713394
|
||||
9650 7.9099018 8.0161955 15.006711
|
||||
9700 7.3372719 7.419692 14.320242
|
||||
9750 7.2075957 7.3109181 14.541501
|
||||
9800 7.6617849 7.7279899 15.018225
|
||||
9850 7.6595385 7.138483 14.400928
|
||||
9900 7.1440851 7.3065973 12.81291
|
||||
9950 7.5757356 7.3889652 14.59353
|
||||
10000 8.5866601 8.347723 16.125389
|
||||
Loop time of 3.74766 on 1 procs for 10000 steps with 500 atoms
|
||||
|
||||
Performance: 946786.828 tau/day, 2191.636 timesteps/s
|
||||
99.9% CPU use with 1 MPI tasks x no OpenMP threads
|
||||
Performance: 1152718.368 tau/day, 2668.330 timesteps/s
|
||||
99.4% CPU use with 1 MPI tasks x no OpenMP threads
|
||||
|
||||
MPI task timing breakdown:
|
||||
Section | min time | avg time | max time |%varavg| %total
|
||||
---------------------------------------------------------------
|
||||
Pair | 0.70711 | 0.70711 | 0.70711 | 0.0 | 15.50
|
||||
Neigh | 2.7689 | 2.7689 | 2.7689 | 0.0 | 60.69
|
||||
Comm | 0.30715 | 0.30715 | 0.30715 | 0.0 | 6.73
|
||||
Output | 0.0036616 | 0.0036616 | 0.0036616 | 0.0 | 0.08
|
||||
Modify | 0.67113 | 0.67113 | 0.67113 | 0.0 | 14.71
|
||||
Other | | 0.1048 | | | 2.30
|
||||
Pair | 0.64903 | 0.64903 | 0.64903 | 0.0 | 17.32
|
||||
Neigh | 2.2534 | 2.2534 | 2.2534 | 0.0 | 60.13
|
||||
Comm | 0.22293 | 0.22293 | 0.22293 | 0.0 | 5.95
|
||||
Output | 0.0034931 | 0.0034931 | 0.0034931 | 0.0 | 0.09
|
||||
Modify | 0.53533 | 0.53533 | 0.53533 | 0.0 | 14.28
|
||||
Other | | 0.08346 | | | 2.23
|
||||
|
||||
Nlocal: 500 ave 500 max 500 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
Nghost: 905 ave 905 max 905 min
|
||||
Nghost: 919 ave 919 max 919 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
Neighs: 3340 ave 3340 max 3340 min
|
||||
Neighs: 3662 ave 3662 max 3662 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
|
||||
Total # of neighbors = 3340
|
||||
Ave neighs/atom = 6.68
|
||||
Neighbor list builds = 4580
|
||||
Total # of neighbors = 3662
|
||||
Ave neighs/atom = 7.324
|
||||
Neighbor list builds = 4480
|
||||
Dangerous builds = 0
|
||||
|
||||
Please see the log.cite file for references relevant to this simulation
|
||||
|
||||
Total wall time: 0:00:04
|
||||
Total wall time: 0:00:03
|
||||
|
||||
@ -52,233 +52,233 @@ Neighbor list info ...
|
||||
Per MPI rank memory allocation (min/avg/max) = 2.71 | 2.71 | 2.71 Mbytes
|
||||
Step c_1_press[1] c_1_press[2] c_1_press[3]
|
||||
0 6.3937851 7.0436438 6.4461087
|
||||
50 7.9020345 7.303289 14.733929
|
||||
100 8.3214325 8.385843 13.166247
|
||||
150 5.7168419 5.6083988 9.7224198
|
||||
200 3.8875348 4.0840705 7.9912973
|
||||
250 4.2933724 4.2410519 7.7200953
|
||||
300 4.5452314 4.2434949 8.6709832
|
||||
350 5.446489 5.6166962 11.300536
|
||||
400 6.0682558 5.7787878 12.106852
|
||||
450 5.3884296 5.5066688 9.9100012
|
||||
500 4.8046418 4.7115986 9.9769201
|
||||
550 4.9043933 4.6240966 9.319336
|
||||
600 4.6843238 4.9571246 9.5325487
|
||||
650 5.1952989 5.195648 9.6187047
|
||||
700 5.4163364 5.2938289 10.136655
|
||||
750 5.6723178 5.0670261 11.415221
|
||||
800 5.9379901 5.6402916 10.815209
|
||||
850 5.0695389 5.3021432 10.742859
|
||||
900 4.6498961 4.7111912 9.8453525
|
||||
950 4.4811637 5.1701321 9.4217645
|
||||
1000 4.750149 4.2420768 9.3510788
|
||||
1050 4.5973376 5.2046787 9.8633025
|
||||
1100 4.7879516 4.9051338 9.8658577
|
||||
1150 5.0528775 5.5048673 10.110905
|
||||
1200 4.992684 5.2482046 9.9610521
|
||||
1250 4.8475843 4.8499105 9.575365
|
||||
1300 5.2930179 5.0593567 10.869332
|
||||
1350 5.4722311 5.0830422 10.69342
|
||||
1400 4.8165864 4.9851485 10.042141
|
||||
1450 4.6276548 4.5643142 9.2306057
|
||||
1500 5.0197119 4.5470582 8.7204541
|
||||
1550 4.878215 5.158312 10.264148
|
||||
1600 5.4917782 5.3121766 10.273923
|
||||
1650 5.4381825 5.1698438 9.9823968
|
||||
1700 4.9206398 5.2852701 9.5806048
|
||||
1750 4.9226742 4.7164231 8.932911
|
||||
1800 4.9733613 4.8776709 9.6638069
|
||||
1850 5.1327098 4.8503755 10.170281
|
||||
1900 5.9114024 6.0045781 10.515973
|
||||
1950 5.2332897 5.7899133 10.436353
|
||||
2000 5.286098 5.3874673 10.124669
|
||||
2050 5.0167541 5.490974 9.6476751
|
||||
2100 5.3933017 5.372036 9.7187857
|
||||
2150 4.8288683 4.7937794 9.2252452
|
||||
2200 5.0760371 4.8515447 9.8373704
|
||||
2250 5.5626387 5.5509581 10.274505
|
||||
2300 5.1009883 4.9400598 10.300516
|
||||
2350 5.3148808 5.4689154 9.9240269
|
||||
2400 4.8720251 4.9341152 10.32893
|
||||
2450 5.1964062 5.394913 9.6729737
|
||||
2500 4.9715986 5.1500527 10.925999
|
||||
2550 5.1240848 4.3358732 9.9783677
|
||||
2600 4.7387276 4.3732544 9.4545219
|
||||
2650 4.6787161 4.7001729 9.4697272
|
||||
2700 5.5549736 5.4437977 10.581898
|
||||
2750 5.523176 5.0416156 10.338311
|
||||
2800 5.3864512 5.439205 10.079435
|
||||
2850 5.5675261 5.2310133 10.524415
|
||||
2900 5.2628013 5.3641439 10.160587
|
||||
2950 4.7300407 4.6838026 8.9617691
|
||||
3000 5.1744361 4.5005726 10.487918
|
||||
3050 5.2239211 5.3030573 10.376913
|
||||
3100 5.1016236 5.0700451 9.4697833
|
||||
3150 5.0661402 5.142376 9.5591223
|
||||
3200 5.397775 4.9229072 10.389504
|
||||
3250 5.5515257 5.2365437 10.265586
|
||||
3300 5.844715 5.2552463 10.065811
|
||||
3350 4.888658 5.0636003 10.129015
|
||||
3400 4.55264 5.0703435 8.7178922
|
||||
3450 4.992088 5.2487278 10.087295
|
||||
3500 5.3469913 4.785277 9.8944509
|
||||
3550 5.217282 5.3011196 9.6306807
|
||||
3600 5.8928519 4.9717327 10.897022
|
||||
3650 6.0118006 5.9046823 11.2352
|
||||
3700 5.0667885 5.2572827 10.266895
|
||||
3750 4.8133435 4.8991016 9.4760522
|
||||
3800 4.5125756 4.8295067 9.0226716
|
||||
3850 4.4651224 4.678168 8.7474636
|
||||
3900 4.9811965 4.687682 9.0547397
|
||||
3950 5.2387906 5.4772104 10.416997
|
||||
4000 5.3576384 5.896421 10.524538
|
||||
4050 5.8265842 5.7449599 10.527804
|
||||
4100 5.2276111 5.1866643 10.1139
|
||||
4150 5.2739201 4.8869905 9.5700647
|
||||
4200 4.7943987 4.4305245 8.8436208
|
||||
4250 4.9285996 4.9591754 10.121985
|
||||
4300 5.5289613 6.0688348 10.898698
|
||||
4350 5.6673111 5.3636174 10.569902
|
||||
4400 4.7882862 5.3060196 10.050009
|
||||
4450 5.1309456 4.9776646 9.8804906
|
||||
4500 5.0629205 4.7277565 8.7584435
|
||||
4550 5.1009496 4.8110658 9.4666416
|
||||
4600 5.5858872 5.4123191 12.263621
|
||||
4650 5.5585654 5.8537188 10.258869
|
||||
4700 4.8064416 5.060519 10.153314
|
||||
4750 4.7181218 5.0631685 9.3624778
|
||||
4800 4.871496 4.8872111 9.7435175
|
||||
4850 4.8297469 4.6464864 9.6852358
|
||||
4900 5.5682142 5.5530971 10.073983
|
||||
4950 5.1322491 5.3402989 10.283117
|
||||
5000 5.4516954 5.6198027 11.223665
|
||||
5050 5.1488128 5.1092478 10.375804
|
||||
5100 4.4000207 4.7355267 9.5152048
|
||||
5150 4.6501804 5.0426405 9.5383808
|
||||
5200 4.8589325 4.9719089 8.8114996
|
||||
5250 5.0343815 4.8677968 10.967149
|
||||
5300 5.6710156 5.5661349 11.436985
|
||||
5350 5.2243912 5.101865 9.9427717
|
||||
5400 4.3337053 4.6325695 9.6917273
|
||||
5450 4.6217314 5.0129144 9.1988349
|
||||
5500 5.1014594 4.7848497 10.516995
|
||||
5550 5.0465061 4.9173385 9.3561229
|
||||
5600 4.8643636 4.860697 10.428496
|
||||
5650 5.6536439 5.4434563 10.014098
|
||||
5700 4.9734376 4.7193345 9.5610177
|
||||
5750 5.3414745 5.148175 11.048378
|
||||
5800 5.4363776 5.0286279 10.85538
|
||||
5850 5.1060233 5.1350774 9.3190058
|
||||
5900 4.5611096 4.4980661 8.8914749
|
||||
5950 4.4264357 4.7757911 8.4601102
|
||||
6000 5.059237 5.6791366 10.779186
|
||||
6050 5.3216769 5.8043231 10.290497
|
||||
6100 5.0261845 5.3700963 10.430661
|
||||
6150 5.8132491 5.5245642 10.675176
|
||||
6200 5.2346131 5.21174 10.332249
|
||||
6250 5.3756188 4.787094 9.7496811
|
||||
6300 5.2054751 4.7341501 10.034542
|
||||
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
||||
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|
||||
5050 8.6041139 8.3498159 16.208856
|
||||
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|
||||
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|
||||
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|
||||
5250 6.9392666 6.3711563 13.014779
|
||||
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|
||||
5350 8.2947591 7.5597033 15.076707
|
||||
5400 7.8365134 8.3559985 14.451289
|
||||
5450 7.6577176 7.8573581 14.649332
|
||||
5500 7.6344288 7.6731281 14.411212
|
||||
5550 7.2854884 7.2377463 14.580478
|
||||
5600 7.6332558 7.5037409 14.809068
|
||||
5650 7.2491454 7.5479013 15.196638
|
||||
5700 7.5027918 8.0434388 14.006705
|
||||
5750 8.4679702 7.2893309 15.600406
|
||||
5800 8.11675 8.7790839 15.150116
|
||||
5850 7.8571033 7.1044939 14.730559
|
||||
5900 7.4555155 6.8841813 13.743156
|
||||
5950 7.4269873 7.4363562 13.722307
|
||||
6000 7.014144 7.2841802 14.010536
|
||||
6050 8.2802859 8.741796 16.724881
|
||||
6100 7.9607544 8.2594316 14.965005
|
||||
6150 7.7505098 7.6437264 14.941281
|
||||
6200 7.2637841 7.2845655 14.922083
|
||||
6250 7.4781943 7.3184749 14.627774
|
||||
6300 7.0053246 7.6973025 14.77968
|
||||
6350 6.9682271 7.2193417 13.261589
|
||||
6400 7.6344736 7.5178683 15.586197
|
||||
6450 8.1803746 8.9186636 15.298001
|
||||
6500 7.9535931 8.0466048 15.058292
|
||||
6550 8.056327 8.7108507 15.645091
|
||||
6600 7.3980755 7.087917 13.188502
|
||||
6650 7.3835052 7.2608077 13.95146
|
||||
6700 7.65293 7.0795957 13.742847
|
||||
6750 7.3562754 7.9842502 14.9349
|
||||
6800 8.2494698 8.1508069 15.314676
|
||||
6850 8.1303284 7.8202726 14.50709
|
||||
6900 6.8743362 7.177725 13.485731
|
||||
6950 7.9101459 7.9096716 14.503653
|
||||
7000 7.8164436 8.3236187 16.081817
|
||||
7050 7.7467975 8.7347369 14.9306
|
||||
7100 7.7324222 7.1489428 14.130705
|
||||
7150 6.7791769 6.9011542 14.121399
|
||||
7200 7.6561999 7.5106057 15.234413
|
||||
7250 8.1336506 8.2347678 15.24865
|
||||
7300 6.9098706 7.1934869 14.762268
|
||||
7350 7.1656572 7.7495163 13.867435
|
||||
7400 7.4777956 7.0012888 14.888226
|
||||
7450 8.3176523 7.7845549 15.400925
|
||||
7500 8.2660801 7.5249967 15.313452
|
||||
7550 7.8682936 7.2724016 15.760637
|
||||
7600 7.3975227 7.5654528 13.588662
|
||||
7650 6.7264804 7.1183131 13.219998
|
||||
7700 7.5072355 7.5540796 15.22008
|
||||
7750 7.7421897 8.0113389 14.385238
|
||||
7800 7.6120438 7.9292888 14.66559
|
||||
7850 8.1731646 7.7092319 15.005626
|
||||
7900 8.2285993 8.0637538 15.54714
|
||||
7950 7.7466424 8.3179588 15.10088
|
||||
8000 6.9988726 7.2092201 12.502859
|
||||
8050 7.0919479 7.0585849 14.613424
|
||||
8100 8.0428791 7.8888417 15.945665
|
||||
8150 8.5677024 8.6618742 15.592526
|
||||
8200 7.5972541 7.6902215 14.030522
|
||||
8250 6.8185307 7.1945156 14.452569
|
||||
8300 7.6384046 7.9698235 13.64607
|
||||
8350 7.8378987 7.547662 15.437631
|
||||
8400 8.2496937 7.8279926 14.684647
|
||||
8450 7.5583846 7.5449624 13.393606
|
||||
8500 7.9690263 7.4398188 15.172533
|
||||
8550 8.9148619 8.1181912 14.965998
|
||||
8600 7.9055582 7.8323691 14.778383
|
||||
8650 7.846331 7.3302071 13.812249
|
||||
8700 7.2669615 6.9949093 14.232954
|
||||
8750 7.7494364 7.4431371 13.748379
|
||||
8800 7.9660017 7.6941365 14.366261
|
||||
8850 7.6599154 7.8343017 14.753737
|
||||
8900 7.623307 7.5207726 15.324822
|
||||
8950 7.4784899 7.7901163 15.290832
|
||||
9000 7.93144 8.1349231 16.08637
|
||||
9050 7.7550193 7.6966669 14.554758
|
||||
9100 7.7952657 7.6029648 13.828782
|
||||
9150 7.2915866 7.2140714 13.882209
|
||||
9200 6.8619177 7.2210075 13.702975
|
||||
9250 8.0756482 7.5893593 15.954582
|
||||
9300 8.022774 7.5747016 14.507683
|
||||
9350 7.4993526 8.1111805 14.917379
|
||||
9400 8.8254745 8.0723829 15.717736
|
||||
9450 7.1983725 7.6626286 13.97487
|
||||
9500 7.0602895 7.6733732 13.883137
|
||||
9550 6.5519083 7.4242978 13.607039
|
||||
9600 8.4732891 7.4177194 15.533846
|
||||
9650 8.9193417 8.5982503 16.110043
|
||||
9700 7.8935173 7.8222315 14.42615
|
||||
9750 7.2393047 7.545224 14.557362
|
||||
9800 6.8495209 7.0841522 13.812737
|
||||
9850 6.9791315 7.5743519 13.013286
|
||||
9900 7.4984681 7.8699746 14.977208
|
||||
9950 8.2030761 8.9314031 17.23834
|
||||
10000 9.3670418 8.2034985 15.902349
|
||||
Loop time of 1.5138 on 4 procs for 10000 steps with 500 atoms
|
||||
|
||||
Performance: 1663904.185 tau/day, 3851.630 timesteps/s
|
||||
99.9% CPU use with 4 MPI tasks x no OpenMP threads
|
||||
Performance: 2853736.392 tau/day, 6605.871 timesteps/s
|
||||
98.4% CPU use with 4 MPI tasks x no OpenMP threads
|
||||
|
||||
MPI task timing breakdown:
|
||||
Section | min time | avg time | max time |%varavg| %total
|
||||
---------------------------------------------------------------
|
||||
Pair | 0.28841 | 0.29049 | 0.29324 | 0.3 | 11.19
|
||||
Neigh | 1.0622 | 1.078 | 1.0899 | 1.0 | 41.52
|
||||
Comm | 0.55877 | 0.56907 | 0.58702 | 1.4 | 21.92
|
||||
Output | 0.0028131 | 0.0034448 | 0.0052423 | 1.8 | 0.13
|
||||
Modify | 0.54339 | 0.54747 | 0.54917 | 0.3 | 21.09
|
||||
Other | | 0.1078 | | | 4.15
|
||||
Pair | 0.16778 | 0.17518 | 0.17885 | 1.0 | 11.57
|
||||
Neigh | 0.55898 | 0.57272 | 0.59026 | 1.6 | 37.83
|
||||
Comm | 0.31971 | 0.33993 | 0.36759 | 3.1 | 22.46
|
||||
Output | 0.003036 | 0.0033901 | 0.0042133 | 0.8 | 0.22
|
||||
Modify | 0.34512 | 0.35303 | 0.35965 | 0.9 | 23.32
|
||||
Other | | 0.06956 | | | 4.60
|
||||
|
||||
Nlocal: 125 ave 128 max 121 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1
|
||||
Nghost: 453.75 ave 460 max 450 min
|
||||
Histogram: 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1
|
||||
Neighs: 845 ave 874 max 787 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1
|
||||
Nlocal: 125 ave 132 max 121 min
|
||||
Histogram: 2 0 0 0 1 0 0 0 0 1
|
||||
Nghost: 478 ave 488 max 470 min
|
||||
Histogram: 1 1 0 0 0 0 1 0 0 1
|
||||
Neighs: 915.25 ave 981 max 889 min
|
||||
Histogram: 3 0 0 0 0 0 0 0 0 1
|
||||
|
||||
Total # of neighbors = 3380
|
||||
Ave neighs/atom = 6.76
|
||||
Neighbor list builds = 4592
|
||||
Total # of neighbors = 3661
|
||||
Ave neighs/atom = 7.322
|
||||
Neighbor list builds = 4485
|
||||
Dangerous builds = 0
|
||||
|
||||
Please see the log.cite file for references relevant to this simulation
|
||||
|
||||
Total wall time: 0:00:02
|
||||
Total wall time: 0:00:01
|
||||
|
||||
@ -1,2 +1,281 @@
|
||||
LAMMPS (22 Sep 2017)
|
||||
Total wall time: 0:00:02
|
||||
# uniaxial NVT deformation of WCA fluid
|
||||
|
||||
units lj
|
||||
atom_style atomic
|
||||
|
||||
|
||||
pair_style lj/cut 1.122562
|
||||
read_data data.wca
|
||||
orthogonal box = (0 0 0) to (8.39798 8.39798 8.39798)
|
||||
1 by 1 by 1 MPI processor grid
|
||||
reading atoms ...
|
||||
500 atoms
|
||||
reading velocities ...
|
||||
500 velocities
|
||||
pair_coeff 1 1 1.0 1.0
|
||||
pair_modify shift yes
|
||||
|
||||
neighbor 0.5 bin
|
||||
neigh_modify delay 0
|
||||
|
||||
change_box all triclinic
|
||||
triclinic box = (0 0 0) to (8.39798 8.39798 8.39798) with tilt (0 0 0)
|
||||
|
||||
fix 1 all nvt/uef temp 0.722 0.722 0.5 erate -0.5 -0.5
|
||||
|
||||
fix 2 all momentum 100 linear 1 1 1
|
||||
|
||||
#dump 1 all atom 25 dump.lammpstrj
|
||||
|
||||
#dump 2 all cfg/uef 25 dump.*.cfg mass type xs ys zs
|
||||
|
||||
thermo_style custom step c_1_press[1] c_1_press[2] c_1_press[3]
|
||||
|
||||
thermo 50
|
||||
run 10000
|
||||
Neighbor list info ...
|
||||
update every 1 steps, delay 0 steps, check yes
|
||||
max neighbors/atom: 2000, page size: 100000
|
||||
master list distance cutoff = 1.62256
|
||||
ghost atom cutoff = 1.62256
|
||||
binsize = 0.811281, bins = 11 11 11
|
||||
1 neighbor lists, perpetual/occasional/extra = 1 0 0
|
||||
(1) pair lj/cut, perpetual
|
||||
attributes: half, newton on
|
||||
pair build: half/bin/newton/tri
|
||||
stencil: half/bin/3d/newton/tri
|
||||
bin: standard
|
||||
Per MPI rank memory allocation (min/avg/max) = 2.742 | 2.742 | 2.742 Mbytes
|
||||
Step c_1_press[1] c_1_press[2] c_1_press[3]
|
||||
0 6.3937851 7.0436438 6.4461087
|
||||
50 10.369902 10.999889 6.5437384
|
||||
100 12.411384 13.145871 7.8892802
|
||||
150 12.88182 12.114068 7.5155182
|
||||
200 10.375571 10.979773 6.5624056
|
||||
250 10.158901 10.251273 5.4525068
|
||||
300 10.011314 9.8371382 5.4031393
|
||||
350 9.4890008 9.7992108 5.054963
|
||||
400 9.1715116 9.2647886 4.9600208
|
||||
450 9.8495961 9.3353483 4.986786
|
||||
500 9.5903809 8.576173 4.8252116
|
||||
550 8.8057509 9.7152078 4.9089022
|
||||
600 8.9743682 10.031277 4.8924072
|
||||
650 10.233852 9.3059527 5.1977058
|
||||
700 9.2361906 9.6439971 5.0923763
|
||||
750 10.449751 9.5911465 5.2548714
|
||||
800 9.8366857 9.9873885 4.9456956
|
||||
850 10.266351 9.9620134 5.0602713
|
||||
900 9.6325813 9.3910946 5.1466624
|
||||
950 9.1911919 9.1519006 4.8275345
|
||||
1000 9.2871712 9.8508501 5.2674099
|
||||
1050 9.7052035 10.291793 5.160359
|
||||
1100 9.9425552 10.361827 5.5520484
|
||||
1150 10.377563 10.26588 5.5997436
|
||||
1200 9.6368269 10.354413 5.4137873
|
||||
1250 9.2071055 9.1706334 4.9800411
|
||||
1300 9.7140516 8.7257777 4.8536943
|
||||
1350 10.145983 9.8247797 4.8921813
|
||||
1400 9.1998975 9.6935675 5.2269871
|
||||
1450 9.4838136 8.9035726 4.6867121
|
||||
1500 9.066389 9.811658 4.8875316
|
||||
1550 10.007083 9.8946118 5.204609
|
||||
1600 9.722137 9.9291588 5.326712
|
||||
1650 9.7424614 9.6995966 5.3577819
|
||||
1700 9.7185135 9.5922931 5.385856
|
||||
1750 9.6368481 8.1414594 5.0046079
|
||||
1800 9.8065782 9.6798036 4.92473
|
||||
1850 9.0463737 10.024205 5.6495695
|
||||
1900 9.0774484 10.527582 5.0363426
|
||||
1950 9.1691461 10.049703 4.8517514
|
||||
2000 9.7619602 10.049532 5.2088038
|
||||
2050 9.9203348 9.8056395 5.7699852
|
||||
2100 9.1455665 9.5864018 5.1410542
|
||||
2150 8.8501135 9.7917307 5.141824
|
||||
2200 9.1433685 9.8168548 5.1742441
|
||||
2250 9.3248968 10.454532 5.5456356
|
||||
2300 10.210505 9.361499 5.0935226
|
||||
2350 9.5041186 9.598986 5.2451005
|
||||
2400 8.968896 9.2811921 4.7799868
|
||||
2450 9.8201159 10.133892 4.9981817
|
||||
2500 9.4421084 9.7875766 5.4124809
|
||||
2550 9.6410643 9.9148309 5.0603288
|
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2600 9.3810676 9.5346849 5.3233836
|
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|
||||
2700 9.405597 9.7848488 4.7537042
|
||||
2750 9.9447412 9.2366502 4.9736459
|
||||
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|
||||
2850 9.6680124 9.0941543 5.0101469
|
||||
2900 8.4350889 9.1595018 4.7706866
|
||||
2950 9.0056117 9.3498593 4.7655963
|
||||
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|
||||
3050 9.6605264 9.4558374 5.1240166
|
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3100 9.681451 9.7966554 5.3174458
|
||||
3150 9.7887528 9.7371194 4.9349103
|
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|
||||
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|
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|
||||
3350 9.0090411 9.5975249 4.8881019
|
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|
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3450 9.7774977 9.7570511 4.8512619
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
||||
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|
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|
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|
||||
4700 11.020014 10.130224 5.582409
|
||||
4750 9.5005142 9.3571561 5.456739
|
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4800 9.6670147 9.6628702 5.0451252
|
||||
4850 9.134147 9.1308788 4.7950594
|
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4900 9.7466206 8.6171443 4.8716275
|
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4950 9.0397505 9.1996036 5.2010502
|
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5000 9.6898652 9.8914655 5.3959279
|
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5050 10.06771 9.7523891 5.3690408
|
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5100 10.000963 9.6279379 5.4077384
|
||||
5150 9.8686159 10.179702 5.0686824
|
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5200 9.8866247 9.725152 5.4350049
|
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5250 9.2068346 10.214424 5.3187713
|
||||
5300 9.713992 9.8069045 5.496359
|
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5350 9.423852 9.364085 5.2144606
|
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|
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|
||||
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|
||||
5550 9.8514653 9.6575827 5.4959779
|
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5600 9.3138107 9.6592624 4.941387
|
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5650 9.1224809 8.7112257 5.0435936
|
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5700 8.8289158 10.749686 4.8916132
|
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5750 9.7200279 10.030606 5.2033161
|
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5800 9.8439873 9.6289015 5.5131934
|
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5850 9.6257294 9.4128988 4.9196038
|
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5900 9.7490214 9.5776313 5.0301815
|
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|
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|
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6050 9.4432774 8.9464304 5.1466052
|
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6100 8.8878373 9.5048946 4.9190238
|
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|
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|
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6250 9.0896505 9.7230651 5.3340322
|
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6300 8.8100599 8.8781352 5.4117914
|
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6350 9.3104601 9.0233294 5.3136432
|
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6400 9.368101 9.6387362 4.7833216
|
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6450 10.334343 9.8384149 5.3606204
|
||||
6500 9.8824036 10.022627 6.0857086
|
||||
6550 9.7034443 10.026765 5.17604
|
||||
6600 9.3757845 9.899268 5.2301359
|
||||
6650 10.540821 10.4343 5.5287065
|
||||
6700 9.6317649 9.8923579 5.6045768
|
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6750 9.5982772 10.07897 5.1221451
|
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6800 10.239883 10.189967 5.3167447
|
||||
6850 10.017271 9.7680902 5.229621
|
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6900 9.6200416 10.129301 5.1998759
|
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6950 9.0361417 8.923798 5.1652612
|
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7000 9.3153521 9.063054 4.6860773
|
||||
7050 8.6434091 9.0363436 4.7811975
|
||||
7100 9.4955395 9.3830541 5.022538
|
||||
7150 9.3392402 9.1847119 5.1544622
|
||||
7200 9.4676321 9.8370036 4.8854442
|
||||
7250 9.5115882 10.350324 4.9780525
|
||||
7300 9.6025583 9.6247917 5.473794
|
||||
7350 9.8919524 10.049446 4.9816931
|
||||
7400 9.6814319 9.9410894 5.265078
|
||||
7450 9.4130955 10.191436 5.2531256
|
||||
7500 9.8114668 8.8461635 5.0562894
|
||||
7550 10.321567 9.4730124 5.2043655
|
||||
7600 9.5059024 9.8330367 5.0749721
|
||||
7650 10.067084 10.606423 5.5598818
|
||||
7700 10.896159 10.084281 5.5159718
|
||||
7750 9.754306 10.162301 5.2475876
|
||||
7800 9.7278145 9.801009 5.0685504
|
||||
7850 9.8639905 10.323104 5.2458864
|
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7900 9.7246799 9.1377357 5.1841319
|
||||
7950 10.381792 9.6977533 5.0977386
|
||||
8000 9.7265224 9.2999829 4.7925571
|
||||
8050 9.5203288 9.3144956 4.7539211
|
||||
8100 9.6900973 9.6614063 5.304712
|
||||
8150 9.713677 9.9154149 4.8178575
|
||||
8200 9.4733597 9.8948632 5.036112
|
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8250 9.7783036 9.9554334 5.3355682
|
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8300 9.4034783 9.9156801 5.5539279
|
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8350 9.2984025 9.2013949 5.0753991
|
||||
8400 9.9299078 9.6166801 5.115776
|
||||
8450 9.526737 9.3312125 4.7800587
|
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8500 9.581956 10.065906 4.9756092
|
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8550 9.2767953 9.326006 5.3024978
|
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8600 9.799968 8.4660845 5.0199109
|
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8650 9.8985354 10.127852 4.9098064
|
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8700 8.7952691 10.521133 5.6840528
|
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8750 9.8299997 9.5588553 5.3085734
|
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8800 9.0811776 9.5704532 5.1684993
|
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8850 9.8303571 9.7618932 5.1251259
|
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8900 9.9238794 9.9654863 5.2999683
|
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8950 10.851304 9.9682289 5.4133763
|
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9000 9.5523794 9.1890766 5.1469144
|
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9050 9.7461948 8.9611236 4.9490826
|
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9100 10.138917 9.6757567 5.0473544
|
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9150 9.4869835 9.4786575 5.0142464
|
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9200 10.263518 10.079135 5.1493398
|
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9250 9.8691684 9.0908275 5.3221203
|
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9300 9.8586707 9.4177643 5.1525265
|
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9350 9.3375816 9.9167208 5.4846207
|
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9400 9.5603903 9.4813199 4.6237495
|
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9450 10.30892 9.5217736 5.6163214
|
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9500 9.327949 9.9831649 4.8923915
|
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9550 9.8421656 9.3202702 5.3352046
|
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9600 8.8543704 9.4556702 4.6430041
|
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9650 10.103399 9.2161072 4.8658062
|
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9700 9.507811 9.9647378 5.227369
|
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9750 9.4988096 8.9942893 5.2491418
|
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9800 9.8007958 9.234452 5.1740203
|
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9850 9.6029685 10.076042 5.023107
|
||||
9900 9.4035691 10.13782 5.2775777
|
||||
9950 9.6517135 10.355994 5.3035779
|
||||
10000 9.9157616 9.7741952 5.5269431
|
||||
Loop time of 3.47119 on 1 procs for 10000 steps with 500 atoms
|
||||
|
||||
Performance: 1244529.812 tau/day, 2880.856 timesteps/s
|
||||
99.5% CPU use with 1 MPI tasks x no OpenMP threads
|
||||
|
||||
MPI task timing breakdown:
|
||||
Section | min time | avg time | max time |%varavg| %total
|
||||
---------------------------------------------------------------
|
||||
Pair | 0.53077 | 0.53077 | 0.53077 | 0.0 | 15.29
|
||||
Neigh | 2.219 | 2.219 | 2.219 | 0.0 | 63.93
|
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Comm | 0.21866 | 0.21866 | 0.21866 | 0.0 | 6.30
|
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|
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|
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Other | | 0.08042 | | | 2.32
|
||||
|
||||
Nlocal: 500 ave 500 max 500 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
Nghost: 908 ave 908 max 908 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
Neighs: 3489 ave 3489 max 3489 min
|
||||
Histogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
|
||||
|
||||
Total # of neighbors = 3489
|
||||
Ave neighs/atom = 6.978
|
||||
Neighbor list builds = 4567
|
||||
Dangerous builds = 0
|
||||
|
||||
Please see the log.cite file for references relevant to this simulation
|
||||
|
||||
Total wall time: 0:00:03
|
||||
|
||||
@ -67,215 +67,215 @@ Step c_1_press[1] c_1_press[2] c_1_press[3]
|
||||
800 9.8366858 9.9873885 4.9456956
|
||||
850 10.266351 9.9620134 5.0602713
|
||||
900 9.6325811 9.3910947 5.1466627
|
||||
950 9.1911905 9.1518996 4.8275336
|
||||
1000 9.2871726 9.8508563 5.2674079
|
||||
1050 9.7052021 10.291782 5.1603606
|
||||
1100 9.9425831 10.361849 5.5520586
|
||||
1150 10.37757 10.265897 5.5997238
|
||||
1200 9.636703 10.354446 5.4138755
|
||||
1250 9.2075215 9.1705175 4.9806575
|
||||
1300 9.7125393 8.7247632 4.8527793
|
||||
1350 10.146277 9.8323819 4.8958397
|
||||
1400 9.1957181 9.7052513 5.2335098
|
||||
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|
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98.4% CPU use with 4 MPI tasks x no OpenMP threads
|
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Histogram: 3 0 0 0 0 0 0 0 0 1
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Nghost: 462.75 ave 468 max 457 min
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Histogram: 1 1 0 0 0 0 0 0 0 2
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Neighs: 861.75 ave 946 max 830 min
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Histogram: 3 0 0 0 0 0 0 0 0 1
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Nlocal: 125 ave 128 max 122 min
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Histogram: 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1
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Nghost: 477 ave 489 max 469 min
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Histogram: 2 0 0 0 0 1 0 0 0 1
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Neighs: 861 ave 877 max 848 min
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Histogram: 1 0 1 0 0 1 0 0 0 1
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Total # of neighbors = 3447
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Ave neighs/atom = 6.894
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Neighbor list builds = 4556
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Total # of neighbors = 3444
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Ave neighs/atom = 6.888
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Neighbor list builds = 4560
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Dangerous builds = 0
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Please see the log.cite file for references relevant to this simulation
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Total wall time: 0:00:02
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Total wall time: 0:00:01
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